Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAT5

Trmu, Mitochondrial tRNA-specific 2-thiouridylase 1, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrmuQ9DAT5 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TrmuQ9DAT5 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TrmuQ9DAT5 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TrmuQ9DAT5 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TrmuQ9DAT5 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TrmuQ9DAT5 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TrmuQ9DAT5 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TrmuQ9DAT5 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TrmuQ9DAT5 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TrmuQ9DAT5 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TrmuQ9DAT5 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TrmuQ9DAT5 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TrmuQ9DAT5 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TrmuQ9DAT5 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TrmuQ9DAT5 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TrmuQ9DAT5 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TrmuQ9DAT5 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TrmuQ9DAT5 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TrmuQ9DAT5 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TrmuQ9DAT5 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TrmuQ9DAT5 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TrmuQ9DAT5 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TrmuQ9DAT5 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TrmuQ9DAT5 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TrmuQ9DAT5 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TrmuQ9DAT5 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TrmuQ9DAT5 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TrmuQ9DAT5 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TrmuQ9DAT5 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TrmuQ9DAT5 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TrmuQ9DAT5 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TrmuQ9DAT5 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TrmuQ9DAT5 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TrmuQ9DAT5 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TrmuQ9DAT5 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TrmuQ9DAT5 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TrmuQ9DAT5 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TrmuQ9DAT5 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TrmuQ9DAT5 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TrmuQ9DAT5 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TrmuQ9DAT5 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TrmuQ9DAT5 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TrmuQ9DAT5 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TrmuQ9DAT5 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TrmuQ9DAT5 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TrmuQ9DAT5 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TrmuQ9DAT5 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TrmuQ9DAT5 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TrmuQ9DAT5 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TrmuQ9DAT5 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TrmuQ9DAT5 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TrmuQ9DAT5 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TrmuQ9DAT5 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TrmuQ9DAT5 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
TrmuQ9DAT5 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TrmuQ9DAT5 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TrmuQ9DAT5 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TrmuQ9DAT5 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TrmuQ9DAT5 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TrmuQ9DAT5 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TrmuQ9DAT5 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TrmuQ9DAT5 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TrmuQ9DAT5 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TrmuQ9DAT5 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TrmuQ9DAT5 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TrmuQ9DAT5 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TrmuQ9DAT5 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TrmuQ9DAT5 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TrmuQ9DAT5 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TrmuQ9DAT5 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TrmuQ9DAT5 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TrmuQ9DAT5 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TrmuQ9DAT5 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TrmuQ9DAT5 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TrmuQ9DAT5 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TrmuQ9DAT5 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TrmuQ9DAT5 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TrmuQ9DAT5 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TrmuQ9DAT5 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TrmuQ9DAT5 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TrmuQ9DAT5 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TrmuQ9DAT5 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TrmuQ9DAT5 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TrmuQ9DAT5 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TrmuQ9DAT5 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TrmuQ9DAT5 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TrmuQ9DAT5 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TrmuQ9DAT5 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TrmuQ9DAT5 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TrmuQ9DAT5 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TrmuQ9DAT5 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TrmuQ9DAT5 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TrmuQ9DAT5 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TrmuQ9DAT5 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TrmuQ9DAT5 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TrmuQ9DAT5 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TrmuQ9DAT5 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TrmuQ9DAT5 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TrmuQ9DAT5 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TrmuQ9DAT5 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms