Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAK3

Rhobtb1, Rho-related BTB domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 695 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhobtb1Q9DAK3 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rhobtb1Q9DAK3 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rhobtb1Q9DAK3 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rhobtb1Q9DAK3 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rhobtb1Q9DAK3 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rhobtb1Q9DAK3 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rhobtb1Q9DAK3 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rhobtb1Q9DAK3 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rhobtb1Q9DAK3 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rhobtb1Q9DAK3 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rhobtb1Q9DAK3 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rhobtb1Q9DAK3 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rhobtb1Q9DAK3 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rhobtb1Q9DAK3 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rhobtb1Q9DAK3 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rhobtb1Q9DAK3 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rhobtb1Q9DAK3 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rhobtb1Q9DAK3 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rhobtb1Q9DAK3 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rhobtb1Q9DAK3 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rhobtb1Q9DAK3 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Rhobtb1Q9DAK3 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rhobtb1Q9DAK3 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rhobtb1Q9DAK3 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rhobtb1Q9DAK3 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rhobtb1Q9DAK3 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rhobtb1Q9DAK3 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rhobtb1Q9DAK3 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rhobtb1Q9DAK3 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rhobtb1Q9DAK3 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rhobtb1Q9DAK3 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rhobtb1Q9DAK3 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rhobtb1Q9DAK3 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rhobtb1Q9DAK3 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rhobtb1Q9DAK3 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rhobtb1Q9DAK3 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rhobtb1Q9DAK3 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rhobtb1Q9DAK3 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rhobtb1Q9DAK3 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rhobtb1Q9DAK3 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Rhobtb1Q9DAK3 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rhobtb1Q9DAK3 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rhobtb1Q9DAK3 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rhobtb1Q9DAK3 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rhobtb1Q9DAK3 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Rhobtb1Q9DAK3 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rhobtb1Q9DAK3 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rhobtb1Q9DAK3 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rhobtb1Q9DAK3 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rhobtb1Q9DAK3 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rhobtb1Q9DAK3 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rhobtb1Q9DAK3 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rhobtb1Q9DAK3 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rhobtb1Q9DAK3 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rhobtb1Q9DAK3 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rhobtb1Q9DAK3 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rhobtb1Q9DAK3 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rhobtb1Q9DAK3 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rhobtb1Q9DAK3 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rhobtb1Q9DAK3 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rhobtb1Q9DAK3 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rhobtb1Q9DAK3 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rhobtb1Q9DAK3 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rhobtb1Q9DAK3 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rhobtb1Q9DAK3 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rhobtb1Q9DAK3 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rhobtb1Q9DAK3 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rhobtb1Q9DAK3 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rhobtb1Q9DAK3 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rhobtb1Q9DAK3 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rhobtb1Q9DAK3 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rhobtb1Q9DAK3 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rhobtb1Q9DAK3 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Rhobtb1Q9DAK3 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rhobtb1Q9DAK3 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rhobtb1Q9DAK3 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rhobtb1Q9DAK3 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rhobtb1Q9DAK3 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rhobtb1Q9DAK3 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rhobtb1Q9DAK3 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rhobtb1Q9DAK3 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rhobtb1Q9DAK3 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rhobtb1Q9DAK3 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rhobtb1Q9DAK3 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rhobtb1Q9DAK3 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rhobtb1Q9DAK3 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rhobtb1Q9DAK3 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rhobtb1Q9DAK3 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rhobtb1Q9DAK3 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rhobtb1Q9DAK3 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rhobtb1Q9DAK3 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rhobtb1Q9DAK3 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Rhobtb1Q9DAK3 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rhobtb1Q9DAK3 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rhobtb1Q9DAK3 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rhobtb1Q9DAK3 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rhobtb1Q9DAK3 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Rhobtb1Q9DAK3 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rhobtb1Q9DAK3 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rhobtb1Q9DAK3 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms