Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAH1

Scp2d1, SCP2 sterol-binding domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scp2d1Q9DAH1 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Scp2d1Q9DAH1 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Scp2d1Q9DAH1 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Scp2d1Q9DAH1 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Scp2d1Q9DAH1 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Scp2d1Q9DAH1 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Scp2d1Q9DAH1 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Scp2d1Q9DAH1 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Scp2d1Q9DAH1 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Scp2d1Q9DAH1 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Scp2d1Q9DAH1 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Scp2d1Q9DAH1 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Scp2d1Q9DAH1 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Scp2d1Q9DAH1 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Scp2d1Q9DAH1 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Scp2d1Q9DAH1 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Scp2d1Q9DAH1 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Scp2d1Q9DAH1 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Scp2d1Q9DAH1 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Scp2d1Q9DAH1 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Scp2d1Q9DAH1 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Scp2d1Q9DAH1 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Scp2d1Q9DAH1 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Scp2d1Q9DAH1 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Scp2d1Q9DAH1 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Scp2d1Q9DAH1 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Scp2d1Q9DAH1 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Scp2d1Q9DAH1 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Scp2d1Q9DAH1 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Scp2d1Q9DAH1 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Scp2d1Q9DAH1 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Scp2d1Q9DAH1 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Scp2d1Q9DAH1 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Scp2d1Q9DAH1 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Scp2d1Q9DAH1 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Scp2d1Q9DAH1 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Scp2d1Q9DAH1 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Scp2d1Q9DAH1 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Scp2d1Q9DAH1 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Scp2d1Q9DAH1 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Scp2d1Q9DAH1 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Scp2d1Q9DAH1 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Scp2d1Q9DAH1 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Scp2d1Q9DAH1 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Scp2d1Q9DAH1 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Scp2d1Q9DAH1 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Scp2d1Q9DAH1 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Scp2d1Q9DAH1 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Scp2d1Q9DAH1 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Scp2d1Q9DAH1 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Scp2d1Q9DAH1 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Scp2d1Q9DAH1 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Scp2d1Q9DAH1 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Scp2d1Q9DAH1 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Scp2d1Q9DAH1 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Scp2d1Q9DAH1 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Scp2d1Q9DAH1 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Scp2d1Q9DAH1 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Scp2d1Q9DAH1 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Scp2d1Q9DAH1 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Scp2d1Q9DAH1 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Scp2d1Q9DAH1 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Scp2d1Q9DAH1 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Scp2d1Q9DAH1 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Scp2d1Q9DAH1 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Scp2d1Q9DAH1 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Scp2d1Q9DAH1 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Scp2d1Q9DAH1 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Scp2d1Q9DAH1 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Scp2d1Q9DAH1 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Scp2d1Q9DAH1 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Scp2d1Q9DAH1 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Scp2d1Q9DAH1 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Scp2d1Q9DAH1 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Scp2d1Q9DAH1 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Scp2d1Q9DAH1 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Scp2d1Q9DAH1 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Scp2d1Q9DAH1 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Scp2d1Q9DAH1 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Scp2d1Q9DAH1 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Scp2d1Q9DAH1 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Scp2d1Q9DAH1 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Scp2d1Q9DAH1 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Scp2d1Q9DAH1 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Scp2d1Q9DAH1 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Scp2d1Q9DAH1 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Scp2d1Q9DAH1 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Scp2d1Q9DAH1 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Scp2d1Q9DAH1 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Scp2d1Q9DAH1 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Scp2d1Q9DAH1 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Scp2d1Q9DAH1 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Scp2d1Q9DAH1 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Scp2d1Q9DAH1 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Scp2d1Q9DAH1 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Scp2d1Q9DAH1 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Scp2d1Q9DAH1 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Scp2d1Q9DAH1 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Scp2d1Q9DAH1 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Scp2d1Q9DAH1 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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