Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA47

Tmem239, Transmembrane protein 239, mousemouse

Predictions only

Length 151 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem239Q9DA47 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tmem239Q9DA47 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tmem239Q9DA47 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tmem239Q9DA47 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tmem239Q9DA47 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tmem239Q9DA47 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tmem239Q9DA47 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tmem239Q9DA47 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tmem239Q9DA47 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tmem239Q9DA47 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tmem239Q9DA47 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tmem239Q9DA47 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tmem239Q9DA47 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tmem239Q9DA47 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tmem239Q9DA47 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tmem239Q9DA47 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tmem239Q9DA47 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Tmem239Q9DA47 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Tmem239Q9DA47 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tmem239Q9DA47 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tmem239Q9DA47 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tmem239Q9DA47 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tmem239Q9DA47 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tmem239Q9DA47 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tmem239Q9DA47 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tmem239Q9DA47 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tmem239Q9DA47 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tmem239Q9DA47 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tmem239Q9DA47 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tmem239Q9DA47 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tmem239Q9DA47 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tmem239Q9DA47 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tmem239Q9DA47 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tmem239Q9DA47 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tmem239Q9DA47 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tmem239Q9DA47 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tmem239Q9DA47 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tmem239Q9DA47 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tmem239Q9DA47 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tmem239Q9DA47 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tmem239Q9DA47 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tmem239Q9DA47 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tmem239Q9DA47 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tmem239Q9DA47 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tmem239Q9DA47 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tmem239Q9DA47 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tmem239Q9DA47 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tmem239Q9DA47 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tmem239Q9DA47 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tmem239Q9DA47 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tmem239Q9DA47 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tmem239Q9DA47 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tmem239Q9DA47 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tmem239Q9DA47 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tmem239Q9DA47 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tmem239Q9DA47 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tmem239Q9DA47 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tmem239Q9DA47 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tmem239Q9DA47 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tmem239Q9DA47 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tmem239Q9DA47 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tmem239Q9DA47 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tmem239Q9DA47 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tmem239Q9DA47 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tmem239Q9DA47 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tmem239Q9DA47 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tmem239Q9DA47 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tmem239Q9DA47 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tmem239Q9DA47 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tmem239Q9DA47 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tmem239Q9DA47 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tmem239Q9DA47 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tmem239Q9DA47 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tmem239Q9DA47 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tmem239Q9DA47 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tmem239Q9DA47 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tmem239Q9DA47 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tmem239Q9DA47 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tmem239Q9DA47 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tmem239Q9DA47 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tmem239Q9DA47 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Tmem239Q9DA47 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Tmem239Q9DA47 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Tmem239Q9DA47 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Tmem239Q9DA47 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Tmem239Q9DA47 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Tmem239Q9DA47 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Tmem239Q9DA47 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Tmem239Q9DA47 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tmem239Q9DA47 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tmem239Q9DA47 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tmem239Q9DA47 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tmem239Q9DA47 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tmem239Q9DA47 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tmem239Q9DA47 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tmem239Q9DA47 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tmem239Q9DA47 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tmem239Q9DA47 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tmem239Q9DA47 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tmem239Q9DA47 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms