Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA21

Smco2, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smco2Q9DA21 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Smco2Q9DA21 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Smco2Q9DA21 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Smco2Q9DA21 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Smco2Q9DA21 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Smco2Q9DA21 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Smco2Q9DA21 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Smco2Q9DA21 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Smco2Q9DA21 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Smco2Q9DA21 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Smco2Q9DA21 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Smco2Q9DA21 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Smco2Q9DA21 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Smco2Q9DA21 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Smco2Q9DA21 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Smco2Q9DA21 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Smco2Q9DA21 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Smco2Q9DA21 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Smco2Q9DA21 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Smco2Q9DA21 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Smco2Q9DA21 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Smco2Q9DA21 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Smco2Q9DA21 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Smco2Q9DA21 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Smco2Q9DA21 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Smco2Q9DA21 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Smco2Q9DA21 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Smco2Q9DA21 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Smco2Q9DA21 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Smco2Q9DA21 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Smco2Q9DA21 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Smco2Q9DA21 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Smco2Q9DA21 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Smco2Q9DA21 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Smco2Q9DA21 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Smco2Q9DA21 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Smco2Q9DA21 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Smco2Q9DA21 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Smco2Q9DA21 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Smco2Q9DA21 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Smco2Q9DA21 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Smco2Q9DA21 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Smco2Q9DA21 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Smco2Q9DA21 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Smco2Q9DA21 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Smco2Q9DA21 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Smco2Q9DA21 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Smco2Q9DA21 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Smco2Q9DA21 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Smco2Q9DA21 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Smco2Q9DA21 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Smco2Q9DA21 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Smco2Q9DA21 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Smco2Q9DA21 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Smco2Q9DA21 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Smco2Q9DA21 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Smco2Q9DA21 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Smco2Q9DA21 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Smco2Q9DA21 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Smco2Q9DA21 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Smco2Q9DA21 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Smco2Q9DA21 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Smco2Q9DA21 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Smco2Q9DA21 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Smco2Q9DA21 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Smco2Q9DA21 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Smco2Q9DA21 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Smco2Q9DA21 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Smco2Q9DA21 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Smco2Q9DA21 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Smco2Q9DA21 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Smco2Q9DA21 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Smco2Q9DA21 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Smco2Q9DA21 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Smco2Q9DA21 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Smco2Q9DA21 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Smco2Q9DA21 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Smco2Q9DA21 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Smco2Q9DA21 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Smco2Q9DA21 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Smco2Q9DA21 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Smco2Q9DA21 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Smco2Q9DA21 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Smco2Q9DA21 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Smco2Q9DA21 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Smco2Q9DA21 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Smco2Q9DA21 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Smco2Q9DA21 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Smco2Q9DA21 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Smco2Q9DA21 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Smco2Q9DA21 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Smco2Q9DA21 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Smco2Q9DA21 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Smco2Q9DA21 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Smco2Q9DA21 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Smco2Q9DA21 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Smco2Q9DA21 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Smco2Q9DA21 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Smco2Q9DA21 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Smco2Q9DA21 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms