Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9D9

Uncharacterized protein C1orf189 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 101 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D9D9 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Q9D9D9 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Q9D9D9 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Q9D9D9 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Q9D9D9 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Q9D9D9 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Q9D9D9 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Q9D9D9 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Q9D9D9 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Q9D9D9 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Q9D9D9 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Q9D9D9 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Q9D9D9 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Q9D9D9 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Q9D9D9 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Q9D9D9 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Q9D9D9 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Q9D9D9 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Q9D9D9 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Q9D9D9 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Q9D9D9 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Q9D9D9 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Q9D9D9 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Q9D9D9 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Q9D9D9 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Q9D9D9 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Q9D9D9 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Q9D9D9 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Q9D9D9 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Q9D9D9 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Q9D9D9 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Q9D9D9 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Q9D9D9 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Q9D9D9 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q9D9D9 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q9D9D9 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q9D9D9 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q9D9D9 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q9D9D9 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q9D9D9 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q9D9D9 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q9D9D9 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q9D9D9 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q9D9D9 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Q9D9D9 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q9D9D9 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q9D9D9 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q9D9D9 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q9D9D9 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q9D9D9 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q9D9D9 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Q9D9D9 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Q9D9D9 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Q9D9D9 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Q9D9D9 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Q9D9D9 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Q9D9D9 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Q9D9D9 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Q9D9D9 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Q9D9D9 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Q9D9D9 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Q9D9D9 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Q9D9D9 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Q9D9D9 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Q9D9D9 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Q9D9D9 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Q9D9D9 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Q9D9D9 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Q9D9D9 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Q9D9D9 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Q9D9D9 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Q9D9D9 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Q9D9D9 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q9D9D9 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q9D9D9 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q9D9D9 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Q9D9D9 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q9D9D9 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q9D9D9 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q9D9D9 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q9D9D9 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q9D9D9 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q9D9D9 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q9D9D9 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q9D9D9 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q9D9D9 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q9D9D9 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q9D9D9 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q9D9D9 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q9D9D9 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q9D9D9 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q9D9D9 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q9D9D9 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q9D9D9 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q9D9D9 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q9D9D9 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q9D9D9 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q9D9D9 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q9D9D9 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q9D9D9 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms