Protein–RNA interactions for Protein: Q9D995

Cntd1, Cyclin N-terminal domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntd1Q9D995 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cntd1Q9D995 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cntd1Q9D995 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Cntd1Q9D995 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cntd1Q9D995 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cntd1Q9D995 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cntd1Q9D995 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cntd1Q9D995 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cntd1Q9D995 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cntd1Q9D995 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cntd1Q9D995 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cntd1Q9D995 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cntd1Q9D995 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cntd1Q9D995 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cntd1Q9D995 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cntd1Q9D995 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cntd1Q9D995 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cntd1Q9D995 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cntd1Q9D995 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cntd1Q9D995 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cntd1Q9D995 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cntd1Q9D995 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cntd1Q9D995 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cntd1Q9D995 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cntd1Q9D995 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cntd1Q9D995 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cntd1Q9D995 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cntd1Q9D995 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cntd1Q9D995 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cntd1Q9D995 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cntd1Q9D995 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cntd1Q9D995 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Cntd1Q9D995 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Cntd1Q9D995 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cntd1Q9D995 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cntd1Q9D995 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cntd1Q9D995 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cntd1Q9D995 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cntd1Q9D995 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cntd1Q9D995 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cntd1Q9D995 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cntd1Q9D995 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cntd1Q9D995 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cntd1Q9D995 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cntd1Q9D995 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cntd1Q9D995 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cntd1Q9D995 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cntd1Q9D995 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cntd1Q9D995 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cntd1Q9D995 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cntd1Q9D995 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Cntd1Q9D995 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cntd1Q9D995 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cntd1Q9D995 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cntd1Q9D995 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cntd1Q9D995 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cntd1Q9D995 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cntd1Q9D995 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cntd1Q9D995 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cntd1Q9D995 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Cntd1Q9D995 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Cntd1Q9D995 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cntd1Q9D995 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cntd1Q9D995 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cntd1Q9D995 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cntd1Q9D995 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cntd1Q9D995 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cntd1Q9D995 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cntd1Q9D995 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cntd1Q9D995 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cntd1Q9D995 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cntd1Q9D995 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cntd1Q9D995 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cntd1Q9D995 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cntd1Q9D995 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cntd1Q9D995 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cntd1Q9D995 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cntd1Q9D995 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cntd1Q9D995 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cntd1Q9D995 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cntd1Q9D995 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cntd1Q9D995 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cntd1Q9D995 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cntd1Q9D995 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cntd1Q9D995 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cntd1Q9D995 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cntd1Q9D995 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cntd1Q9D995 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cntd1Q9D995 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cntd1Q9D995 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cntd1Q9D995 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cntd1Q9D995 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cntd1Q9D995 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cntd1Q9D995 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cntd1Q9D995 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cntd1Q9D995 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cntd1Q9D995 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cntd1Q9D995 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cntd1Q9D995 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cntd1Q9D995 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.7 ms