Protein–RNA interactions for Protein: Q9D906

Atg7, Ubiquitin-like modifier-activating enzyme ATG7, mousemouse

Predictions only

Length 698 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg7Q9D906 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Atg7Q9D906 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atg7Q9D906 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atg7Q9D906 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atg7Q9D906 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atg7Q9D906 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atg7Q9D906 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atg7Q9D906 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atg7Q9D906 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Atg7Q9D906 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atg7Q9D906 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atg7Q9D906 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atg7Q9D906 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atg7Q9D906 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atg7Q9D906 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atg7Q9D906 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atg7Q9D906 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atg7Q9D906 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atg7Q9D906 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atg7Q9D906 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atg7Q9D906 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atg7Q9D906 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atg7Q9D906 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atg7Q9D906 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atg7Q9D906 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atg7Q9D906 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atg7Q9D906 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atg7Q9D906 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atg7Q9D906 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atg7Q9D906 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atg7Q9D906 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atg7Q9D906 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atg7Q9D906 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atg7Q9D906 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atg7Q9D906 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atg7Q9D906 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atg7Q9D906 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atg7Q9D906 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atg7Q9D906 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atg7Q9D906 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atg7Q9D906 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atg7Q9D906 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atg7Q9D906 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atg7Q9D906 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atg7Q9D906 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atg7Q9D906 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atg7Q9D906 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atg7Q9D906 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atg7Q9D906 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atg7Q9D906 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atg7Q9D906 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atg7Q9D906 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atg7Q9D906 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atg7Q9D906 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atg7Q9D906 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atg7Q9D906 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atg7Q9D906 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atg7Q9D906 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atg7Q9D906 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atg7Q9D906 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Atg7Q9D906 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atg7Q9D906 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atg7Q9D906 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atg7Q9D906 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atg7Q9D906 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atg7Q9D906 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atg7Q9D906 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atg7Q9D906 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atg7Q9D906 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atg7Q9D906 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atg7Q9D906 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atg7Q9D906 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atg7Q9D906 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atg7Q9D906 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atg7Q9D906 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atg7Q9D906 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atg7Q9D906 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atg7Q9D906 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atg7Q9D906 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atg7Q9D906 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atg7Q9D906 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atg7Q9D906 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atg7Q9D906 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Atg7Q9D906 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atg7Q9D906 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atg7Q9D906 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atg7Q9D906 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atg7Q9D906 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atg7Q9D906 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atg7Q9D906 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atg7Q9D906 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atg7Q9D906 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atg7Q9D906 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atg7Q9D906 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atg7Q9D906 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atg7Q9D906 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atg7Q9D906 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atg7Q9D906 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atg7Q9D906 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atg7Q9D906 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms