Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8T7

Slirp, SRA stem-loop-interacting RNA-binding protein, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 112 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SlirpQ9D8T7 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SlirpQ9D8T7 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SlirpQ9D8T7 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SlirpQ9D8T7 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SlirpQ9D8T7 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SlirpQ9D8T7 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SlirpQ9D8T7 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SlirpQ9D8T7 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SlirpQ9D8T7 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SlirpQ9D8T7 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SlirpQ9D8T7 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SlirpQ9D8T7 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SlirpQ9D8T7 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SlirpQ9D8T7 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SlirpQ9D8T7 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SlirpQ9D8T7 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SlirpQ9D8T7 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SlirpQ9D8T7 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SlirpQ9D8T7 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
SlirpQ9D8T7 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SlirpQ9D8T7 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SlirpQ9D8T7 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SlirpQ9D8T7 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SlirpQ9D8T7 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SlirpQ9D8T7 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SlirpQ9D8T7 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SlirpQ9D8T7 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SlirpQ9D8T7 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SlirpQ9D8T7 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SlirpQ9D8T7 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SlirpQ9D8T7 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SlirpQ9D8T7 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SlirpQ9D8T7 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SlirpQ9D8T7 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SlirpQ9D8T7 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SlirpQ9D8T7 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SlirpQ9D8T7 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SlirpQ9D8T7 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SlirpQ9D8T7 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SlirpQ9D8T7 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SlirpQ9D8T7 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SlirpQ9D8T7 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SlirpQ9D8T7 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SlirpQ9D8T7 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SlirpQ9D8T7 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SlirpQ9D8T7 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SlirpQ9D8T7 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SlirpQ9D8T7 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SlirpQ9D8T7 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SlirpQ9D8T7 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SlirpQ9D8T7 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
SlirpQ9D8T7 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SlirpQ9D8T7 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SlirpQ9D8T7 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SlirpQ9D8T7 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SlirpQ9D8T7 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SlirpQ9D8T7 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SlirpQ9D8T7 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SlirpQ9D8T7 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SlirpQ9D8T7 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
SlirpQ9D8T7 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SlirpQ9D8T7 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SlirpQ9D8T7 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SlirpQ9D8T7 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SlirpQ9D8T7 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
SlirpQ9D8T7 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SlirpQ9D8T7 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SlirpQ9D8T7 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SlirpQ9D8T7 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SlirpQ9D8T7 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SlirpQ9D8T7 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SlirpQ9D8T7 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SlirpQ9D8T7 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SlirpQ9D8T7 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
SlirpQ9D8T7 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SlirpQ9D8T7 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SlirpQ9D8T7 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SlirpQ9D8T7 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SlirpQ9D8T7 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SlirpQ9D8T7 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SlirpQ9D8T7 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SlirpQ9D8T7 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SlirpQ9D8T7 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SlirpQ9D8T7 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SlirpQ9D8T7 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SlirpQ9D8T7 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SlirpQ9D8T7 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SlirpQ9D8T7 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SlirpQ9D8T7 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SlirpQ9D8T7 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SlirpQ9D8T7 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SlirpQ9D8T7 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SlirpQ9D8T7 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SlirpQ9D8T7 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SlirpQ9D8T7 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SlirpQ9D8T7 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SlirpQ9D8T7 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SlirpQ9D8T7 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SlirpQ9D8T7 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SlirpQ9D8T7 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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