Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8T4

Tvp23b, Golgi apparatus membrane protein TVP23 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tvp23bQ9D8T4 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tvp23bQ9D8T4 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tvp23bQ9D8T4 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tvp23bQ9D8T4 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tvp23bQ9D8T4 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tvp23bQ9D8T4 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tvp23bQ9D8T4 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tvp23bQ9D8T4 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tvp23bQ9D8T4 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tvp23bQ9D8T4 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tvp23bQ9D8T4 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tvp23bQ9D8T4 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tvp23bQ9D8T4 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tvp23bQ9D8T4 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tvp23bQ9D8T4 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Tvp23bQ9D8T4 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tvp23bQ9D8T4 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tvp23bQ9D8T4 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tvp23bQ9D8T4 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tvp23bQ9D8T4 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tvp23bQ9D8T4 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tvp23bQ9D8T4 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tvp23bQ9D8T4 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tvp23bQ9D8T4 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tvp23bQ9D8T4 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tvp23bQ9D8T4 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tvp23bQ9D8T4 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tvp23bQ9D8T4 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tvp23bQ9D8T4 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tvp23bQ9D8T4 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tvp23bQ9D8T4 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tvp23bQ9D8T4 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tvp23bQ9D8T4 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tvp23bQ9D8T4 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tvp23bQ9D8T4 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tvp23bQ9D8T4 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tvp23bQ9D8T4 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tvp23bQ9D8T4 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tvp23bQ9D8T4 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tvp23bQ9D8T4 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tvp23bQ9D8T4 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tvp23bQ9D8T4 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tvp23bQ9D8T4 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tvp23bQ9D8T4 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tvp23bQ9D8T4 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tvp23bQ9D8T4 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tvp23bQ9D8T4 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tvp23bQ9D8T4 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tvp23bQ9D8T4 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tvp23bQ9D8T4 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tvp23bQ9D8T4 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Tvp23bQ9D8T4 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tvp23bQ9D8T4 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tvp23bQ9D8T4 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tvp23bQ9D8T4 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tvp23bQ9D8T4 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tvp23bQ9D8T4 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tvp23bQ9D8T4 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tvp23bQ9D8T4 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tvp23bQ9D8T4 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tvp23bQ9D8T4 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tvp23bQ9D8T4 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tvp23bQ9D8T4 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tvp23bQ9D8T4 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tvp23bQ9D8T4 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tvp23bQ9D8T4 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tvp23bQ9D8T4 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tvp23bQ9D8T4 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tvp23bQ9D8T4 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tvp23bQ9D8T4 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tvp23bQ9D8T4 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tvp23bQ9D8T4 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tvp23bQ9D8T4 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tvp23bQ9D8T4 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Tvp23bQ9D8T4 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tvp23bQ9D8T4 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tvp23bQ9D8T4 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tvp23bQ9D8T4 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tvp23bQ9D8T4 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tvp23bQ9D8T4 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tvp23bQ9D8T4 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tvp23bQ9D8T4 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tvp23bQ9D8T4 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tvp23bQ9D8T4 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tvp23bQ9D8T4 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tvp23bQ9D8T4 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tvp23bQ9D8T4 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tvp23bQ9D8T4 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tvp23bQ9D8T4 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tvp23bQ9D8T4 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tvp23bQ9D8T4 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tvp23bQ9D8T4 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tvp23bQ9D8T4 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tvp23bQ9D8T4 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tvp23bQ9D8T4 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tvp23bQ9D8T4 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tvp23bQ9D8T4 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tvp23bQ9D8T4 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tvp23bQ9D8T4 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tvp23bQ9D8T4 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms