Protein–RNA interactions for Protein: Q9D869

Chp2, Calcineurin B homologous protein 2, mousemouse

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Length 196 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chp2Q9D869 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chp2Q9D869 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chp2Q9D869 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chp2Q9D869 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chp2Q9D869 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chp2Q9D869 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chp2Q9D869 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chp2Q9D869 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chp2Q9D869 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chp2Q9D869 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chp2Q9D869 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chp2Q9D869 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chp2Q9D869 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chp2Q9D869 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chp2Q9D869 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chp2Q9D869 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chp2Q9D869 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chp2Q9D869 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chp2Q9D869 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Chp2Q9D869 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chp2Q9D869 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chp2Q9D869 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chp2Q9D869 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chp2Q9D869 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chp2Q9D869 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chp2Q9D869 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chp2Q9D869 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
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Chp2Q9D869 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chp2Q9D869 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chp2Q9D869 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Chp2Q9D869 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chp2Q9D869 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chp2Q9D869 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chp2Q9D869 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chp2Q9D869 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chp2Q9D869 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chp2Q9D869 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chp2Q9D869 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chp2Q9D869 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chp2Q9D869 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chp2Q9D869 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chp2Q9D869 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chp2Q9D869 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chp2Q9D869 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chp2Q9D869 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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Chp2Q9D869 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chp2Q9D869 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chp2Q9D869 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chp2Q9D869 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chp2Q9D869 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chp2Q9D869 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chp2Q9D869 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chp2Q9D869 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chp2Q9D869 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chp2Q9D869 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chp2Q9D869 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chp2Q9D869 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chp2Q9D869 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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Chp2Q9D869 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chp2Q9D869 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chp2Q9D869 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chp2Q9D869 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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Chp2Q9D869 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chp2Q9D869 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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Chp2Q9D869 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chp2Q9D869 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chp2Q9D869 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chp2Q9D869 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chp2Q9D869 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chp2Q9D869 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chp2Q9D869 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chp2Q9D869 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chp2Q9D869 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chp2Q9D869 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chp2Q9D869 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chp2Q9D869 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chp2Q9D869 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chp2Q9D869 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chp2Q9D869 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chp2Q9D869 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Chp2Q9D869 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chp2Q9D869 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chp2Q9D869 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chp2Q9D869 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms