Protein–RNA interactions for Protein: Q9D824

Fip1l1, Pre-mRNA 3'-end-processing factor FIP1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fip1l1Q9D824 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fip1l1Q9D824 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fip1l1Q9D824 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fip1l1Q9D824 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fip1l1Q9D824 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fip1l1Q9D824 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fip1l1Q9D824 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fip1l1Q9D824 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fip1l1Q9D824 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fip1l1Q9D824 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Fip1l1Q9D824 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fip1l1Q9D824 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fip1l1Q9D824 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fip1l1Q9D824 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fip1l1Q9D824 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fip1l1Q9D824 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fip1l1Q9D824 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fip1l1Q9D824 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fip1l1Q9D824 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fip1l1Q9D824 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fip1l1Q9D824 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fip1l1Q9D824 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fip1l1Q9D824 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fip1l1Q9D824 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fip1l1Q9D824 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fip1l1Q9D824 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Fip1l1Q9D824 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fip1l1Q9D824 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fip1l1Q9D824 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fip1l1Q9D824 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fip1l1Q9D824 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fip1l1Q9D824 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fip1l1Q9D824 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fip1l1Q9D824 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fip1l1Q9D824 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fip1l1Q9D824 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Fip1l1Q9D824 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fip1l1Q9D824 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fip1l1Q9D824 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fip1l1Q9D824 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fip1l1Q9D824 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fip1l1Q9D824 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fip1l1Q9D824 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fip1l1Q9D824 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fip1l1Q9D824 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fip1l1Q9D824 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Fip1l1Q9D824 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Fip1l1Q9D824 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Fip1l1Q9D824 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Fip1l1Q9D824 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Fip1l1Q9D824 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Fip1l1Q9D824 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Fip1l1Q9D824 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Fip1l1Q9D824 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Fip1l1Q9D824 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Fip1l1Q9D824 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Fip1l1Q9D824 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Fip1l1Q9D824 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Fip1l1Q9D824 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Fip1l1Q9D824 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Fip1l1Q9D824 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Fip1l1Q9D824 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Fip1l1Q9D824 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Fip1l1Q9D824 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Fip1l1Q9D824 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Fip1l1Q9D824 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fip1l1Q9D824 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fip1l1Q9D824 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fip1l1Q9D824 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fip1l1Q9D824 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fip1l1Q9D824 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fip1l1Q9D824 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fip1l1Q9D824 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fip1l1Q9D824 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fip1l1Q9D824 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fip1l1Q9D824 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fip1l1Q9D824 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fip1l1Q9D824 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fip1l1Q9D824 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fip1l1Q9D824 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fip1l1Q9D824 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Fip1l1Q9D824 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Fip1l1Q9D824 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Fip1l1Q9D824 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Fip1l1Q9D824 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Fip1l1Q9D824 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Fip1l1Q9D824 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Fip1l1Q9D824 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Fip1l1Q9D824 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Fip1l1Q9D824 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Fip1l1Q9D824 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Fip1l1Q9D824 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Fip1l1Q9D824 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Fip1l1Q9D824 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Fip1l1Q9D824 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Fip1l1Q9D824 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Fip1l1Q9D824 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Fip1l1Q9D824 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Fip1l1Q9D824 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Fip1l1Q9D824 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms