Protein–RNA interactions for Protein: Q9D805

Capn9, Calpain-9, mousemouse

Predictions only

Length 690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn9Q9D805 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Capn9Q9D805 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Capn9Q9D805 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Capn9Q9D805 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Capn9Q9D805 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Capn9Q9D805 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Capn9Q9D805 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Capn9Q9D805 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Capn9Q9D805 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Capn9Q9D805 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Capn9Q9D805 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Capn9Q9D805 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Capn9Q9D805 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Capn9Q9D805 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Capn9Q9D805 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Capn9Q9D805 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Capn9Q9D805 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Capn9Q9D805 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Capn9Q9D805 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Capn9Q9D805 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Capn9Q9D805 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Capn9Q9D805 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Capn9Q9D805 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Capn9Q9D805 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Capn9Q9D805 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Capn9Q9D805 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Capn9Q9D805 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Capn9Q9D805 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Capn9Q9D805 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Capn9Q9D805 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Capn9Q9D805 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Capn9Q9D805 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Capn9Q9D805 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Capn9Q9D805 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Capn9Q9D805 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Capn9Q9D805 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Capn9Q9D805 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Capn9Q9D805 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Capn9Q9D805 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Capn9Q9D805 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Capn9Q9D805 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Capn9Q9D805 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Capn9Q9D805 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Capn9Q9D805 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Capn9Q9D805 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Capn9Q9D805 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Capn9Q9D805 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Capn9Q9D805 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Capn9Q9D805 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Capn9Q9D805 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Capn9Q9D805 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Capn9Q9D805 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Capn9Q9D805 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Capn9Q9D805 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Capn9Q9D805 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Capn9Q9D805 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Capn9Q9D805 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Capn9Q9D805 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Capn9Q9D805 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Capn9Q9D805 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Capn9Q9D805 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Capn9Q9D805 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Capn9Q9D805 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Capn9Q9D805 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Capn9Q9D805 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Capn9Q9D805 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Capn9Q9D805 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Capn9Q9D805 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Capn9Q9D805 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Capn9Q9D805 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Capn9Q9D805 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Capn9Q9D805 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Capn9Q9D805 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Capn9Q9D805 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Capn9Q9D805 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Capn9Q9D805 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Capn9Q9D805 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Capn9Q9D805 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Capn9Q9D805 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Capn9Q9D805 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Capn9Q9D805 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Capn9Q9D805 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Capn9Q9D805 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Capn9Q9D805 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Capn9Q9D805 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Capn9Q9D805 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Capn9Q9D805 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Capn9Q9D805 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Capn9Q9D805 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Capn9Q9D805 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Capn9Q9D805 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Capn9Q9D805 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Capn9Q9D805 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Capn9Q9D805 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Capn9Q9D805 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Capn9Q9D805 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Capn9Q9D805 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Capn9Q9D805 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Capn9Q9D805 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Capn9Q9D805 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms