Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7L8

Tmigd1, Transmembrane and immunoglobulin domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmigd1Q9D7L8 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tmigd1Q9D7L8 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tmigd1Q9D7L8 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Tmigd1Q9D7L8 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Tmigd1Q9D7L8 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tmigd1Q9D7L8 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tmigd1Q9D7L8 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tmigd1Q9D7L8 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tmigd1Q9D7L8 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tmigd1Q9D7L8 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tmigd1Q9D7L8 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tmigd1Q9D7L8 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tmigd1Q9D7L8 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tmigd1Q9D7L8 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tmigd1Q9D7L8 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tmigd1Q9D7L8 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tmigd1Q9D7L8 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tmigd1Q9D7L8 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tmigd1Q9D7L8 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tmigd1Q9D7L8 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tmigd1Q9D7L8 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tmigd1Q9D7L8 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tmigd1Q9D7L8 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tmigd1Q9D7L8 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tmigd1Q9D7L8 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tmigd1Q9D7L8 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tmigd1Q9D7L8 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tmigd1Q9D7L8 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tmigd1Q9D7L8 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tmigd1Q9D7L8 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tmigd1Q9D7L8 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tmigd1Q9D7L8 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tmigd1Q9D7L8 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tmigd1Q9D7L8 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tmigd1Q9D7L8 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tmigd1Q9D7L8 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tmigd1Q9D7L8 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tmigd1Q9D7L8 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tmigd1Q9D7L8 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tmigd1Q9D7L8 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Tmigd1Q9D7L8 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tmigd1Q9D7L8 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tmigd1Q9D7L8 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tmigd1Q9D7L8 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tmigd1Q9D7L8 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tmigd1Q9D7L8 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tmigd1Q9D7L8 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tmigd1Q9D7L8 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Tmigd1Q9D7L8 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Tmigd1Q9D7L8 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tmigd1Q9D7L8 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tmigd1Q9D7L8 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tmigd1Q9D7L8 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tmigd1Q9D7L8 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tmigd1Q9D7L8 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tmigd1Q9D7L8 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tmigd1Q9D7L8 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tmigd1Q9D7L8 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tmigd1Q9D7L8 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tmigd1Q9D7L8 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tmigd1Q9D7L8 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tmigd1Q9D7L8 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tmigd1Q9D7L8 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tmigd1Q9D7L8 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tmigd1Q9D7L8 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tmigd1Q9D7L8 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tmigd1Q9D7L8 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tmigd1Q9D7L8 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tmigd1Q9D7L8 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tmigd1Q9D7L8 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tmigd1Q9D7L8 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tmigd1Q9D7L8 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Tmigd1Q9D7L8 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tmigd1Q9D7L8 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tmigd1Q9D7L8 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tmigd1Q9D7L8 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tmigd1Q9D7L8 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tmigd1Q9D7L8 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tmigd1Q9D7L8 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tmigd1Q9D7L8 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Tmigd1Q9D7L8 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tmigd1Q9D7L8 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tmigd1Q9D7L8 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tmigd1Q9D7L8 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tmigd1Q9D7L8 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tmigd1Q9D7L8 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tmigd1Q9D7L8 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tmigd1Q9D7L8 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tmigd1Q9D7L8 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tmigd1Q9D7L8 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tmigd1Q9D7L8 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tmigd1Q9D7L8 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tmigd1Q9D7L8 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tmigd1Q9D7L8 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tmigd1Q9D7L8 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tmigd1Q9D7L8 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tmigd1Q9D7L8 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tmigd1Q9D7L8 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tmigd1Q9D7L8 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tmigd1Q9D7L8 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms