Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7L5

2310002L09Rik, RIKEN cDNA 2310002L09 gene, mousemouse

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
2310002L09RikQ9D7L5 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
2310002L09RikQ9D7L5 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
2310002L09RikQ9D7L5 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
2310002L09RikQ9D7L5 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
2310002L09RikQ9D7L5 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
2310002L09RikQ9D7L5 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
2310002L09RikQ9D7L5 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
2310002L09RikQ9D7L5 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
2310002L09RikQ9D7L5 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
2310002L09RikQ9D7L5 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
2310002L09RikQ9D7L5 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
2310002L09RikQ9D7L5 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
2310002L09RikQ9D7L5 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
2310002L09RikQ9D7L5 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
2310002L09RikQ9D7L5 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
2310002L09RikQ9D7L5 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
2310002L09RikQ9D7L5 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
2310002L09RikQ9D7L5 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
2310002L09RikQ9D7L5 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
2310002L09RikQ9D7L5 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
2310002L09RikQ9D7L5 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
2310002L09RikQ9D7L5 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
2310002L09RikQ9D7L5 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
2310002L09RikQ9D7L5 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
2310002L09RikQ9D7L5 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
2310002L09RikQ9D7L5 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
2310002L09RikQ9D7L5 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
2310002L09RikQ9D7L5 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
2310002L09RikQ9D7L5 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
2310002L09RikQ9D7L5 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
2310002L09RikQ9D7L5 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
2310002L09RikQ9D7L5 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
2310002L09RikQ9D7L5 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
2310002L09RikQ9D7L5 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
2310002L09RikQ9D7L5 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
2310002L09RikQ9D7L5 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
2310002L09RikQ9D7L5 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
2310002L09RikQ9D7L5 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
2310002L09RikQ9D7L5 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
2310002L09RikQ9D7L5 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
2310002L09RikQ9D7L5 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
2310002L09RikQ9D7L5 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
2310002L09RikQ9D7L5 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
2310002L09RikQ9D7L5 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
2310002L09RikQ9D7L5 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
2310002L09RikQ9D7L5 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
2310002L09RikQ9D7L5 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
2310002L09RikQ9D7L5 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
2310002L09RikQ9D7L5 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
2310002L09RikQ9D7L5 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
2310002L09RikQ9D7L5 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
2310002L09RikQ9D7L5 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
2310002L09RikQ9D7L5 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
2310002L09RikQ9D7L5 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
2310002L09RikQ9D7L5 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
2310002L09RikQ9D7L5 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
2310002L09RikQ9D7L5 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
2310002L09RikQ9D7L5 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
2310002L09RikQ9D7L5 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
2310002L09RikQ9D7L5 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
2310002L09RikQ9D7L5 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
2310002L09RikQ9D7L5 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
2310002L09RikQ9D7L5 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
2310002L09RikQ9D7L5 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
2310002L09RikQ9D7L5 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
2310002L09RikQ9D7L5 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
2310002L09RikQ9D7L5 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
2310002L09RikQ9D7L5 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
2310002L09RikQ9D7L5 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
2310002L09RikQ9D7L5 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
2310002L09RikQ9D7L5 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
2310002L09RikQ9D7L5 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
2310002L09RikQ9D7L5 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
2310002L09RikQ9D7L5 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
2310002L09RikQ9D7L5 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
2310002L09RikQ9D7L5 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
2310002L09RikQ9D7L5 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
2310002L09RikQ9D7L5 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
2310002L09RikQ9D7L5 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
2310002L09RikQ9D7L5 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
2310002L09RikQ9D7L5 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
2310002L09RikQ9D7L5 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
2310002L09RikQ9D7L5 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
2310002L09RikQ9D7L5 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
2310002L09RikQ9D7L5 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
2310002L09RikQ9D7L5 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
2310002L09RikQ9D7L5 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
2310002L09RikQ9D7L5 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
2310002L09RikQ9D7L5 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
2310002L09RikQ9D7L5 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
2310002L09RikQ9D7L5 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
2310002L09RikQ9D7L5 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
2310002L09RikQ9D7L5 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
2310002L09RikQ9D7L5 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
2310002L09RikQ9D7L5 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
2310002L09RikQ9D7L5 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
2310002L09RikQ9D7L5 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
2310002L09RikQ9D7L5 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
2310002L09RikQ9D7L5 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
2310002L09RikQ9D7L5 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.9 ms