Protein–RNA interactions for Protein: Q9D783

Klhl40, Kelch-like protein 40, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl40Q9D783 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Klhl40Q9D783 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Klhl40Q9D783 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Klhl40Q9D783 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Klhl40Q9D783 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Klhl40Q9D783 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Klhl40Q9D783 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Klhl40Q9D783 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Klhl40Q9D783 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Klhl40Q9D783 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Klhl40Q9D783 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Klhl40Q9D783 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Klhl40Q9D783 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Klhl40Q9D783 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Klhl40Q9D783 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Klhl40Q9D783 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Klhl40Q9D783 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Klhl40Q9D783 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Klhl40Q9D783 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Klhl40Q9D783 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Klhl40Q9D783 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Klhl40Q9D783 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Klhl40Q9D783 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Klhl40Q9D783 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Klhl40Q9D783 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Klhl40Q9D783 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Klhl40Q9D783 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Klhl40Q9D783 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Klhl40Q9D783 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Klhl40Q9D783 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Klhl40Q9D783 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Klhl40Q9D783 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Klhl40Q9D783 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Klhl40Q9D783 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Klhl40Q9D783 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Klhl40Q9D783 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Klhl40Q9D783 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Klhl40Q9D783 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Klhl40Q9D783 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Klhl40Q9D783 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Klhl40Q9D783 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Klhl40Q9D783 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Klhl40Q9D783 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Klhl40Q9D783 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Klhl40Q9D783 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Klhl40Q9D783 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Klhl40Q9D783 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Klhl40Q9D783 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Klhl40Q9D783 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Klhl40Q9D783 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Klhl40Q9D783 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Klhl40Q9D783 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Klhl40Q9D783 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Klhl40Q9D783 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Klhl40Q9D783 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Klhl40Q9D783 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Klhl40Q9D783 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Klhl40Q9D783 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Klhl40Q9D783 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Klhl40Q9D783 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Klhl40Q9D783 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Klhl40Q9D783 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Klhl40Q9D783 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Klhl40Q9D783 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Klhl40Q9D783 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Klhl40Q9D783 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Klhl40Q9D783 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Klhl40Q9D783 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Klhl40Q9D783 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Klhl40Q9D783 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Klhl40Q9D783 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Klhl40Q9D783 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Klhl40Q9D783 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Klhl40Q9D783 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Klhl40Q9D783 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Klhl40Q9D783 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Klhl40Q9D783 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Klhl40Q9D783 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Klhl40Q9D783 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Klhl40Q9D783 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Klhl40Q9D783 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Klhl40Q9D783 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Klhl40Q9D783 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Klhl40Q9D783 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Klhl40Q9D783 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Klhl40Q9D783 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Klhl40Q9D783 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Klhl40Q9D783 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Klhl40Q9D783 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Klhl40Q9D783 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Klhl40Q9D783 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Klhl40Q9D783 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Klhl40Q9D783 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Klhl40Q9D783 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Klhl40Q9D783 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Klhl40Q9D783 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Klhl40Q9D783 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Klhl40Q9D783 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Klhl40Q9D783 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Klhl40Q9D783 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms