Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6X5

Slc52a3, Solute carrier family 52, riboflavin transporter, member 3, mousemouse

Predictions only

Length 460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc52a3Q9D6X5 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc52a3Q9D6X5 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc52a3Q9D6X5 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc52a3Q9D6X5 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc52a3Q9D6X5 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc52a3Q9D6X5 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc52a3Q9D6X5 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc52a3Q9D6X5 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc52a3Q9D6X5 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc52a3Q9D6X5 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc52a3Q9D6X5 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc52a3Q9D6X5 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc52a3Q9D6X5 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc52a3Q9D6X5 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc52a3Q9D6X5 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc52a3Q9D6X5 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc52a3Q9D6X5 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc52a3Q9D6X5 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc52a3Q9D6X5 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc52a3Q9D6X5 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc52a3Q9D6X5 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc52a3Q9D6X5 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc52a3Q9D6X5 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc52a3Q9D6X5 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc52a3Q9D6X5 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc52a3Q9D6X5 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc52a3Q9D6X5 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc52a3Q9D6X5 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc52a3Q9D6X5 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc52a3Q9D6X5 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc52a3Q9D6X5 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc52a3Q9D6X5 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc52a3Q9D6X5 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc52a3Q9D6X5 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc52a3Q9D6X5 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc52a3Q9D6X5 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc52a3Q9D6X5 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc52a3Q9D6X5 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc52a3Q9D6X5 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc52a3Q9D6X5 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc52a3Q9D6X5 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc52a3Q9D6X5 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc52a3Q9D6X5 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc52a3Q9D6X5 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc52a3Q9D6X5 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc52a3Q9D6X5 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc52a3Q9D6X5 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc52a3Q9D6X5 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc52a3Q9D6X5 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc52a3Q9D6X5 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc52a3Q9D6X5 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc52a3Q9D6X5 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc52a3Q9D6X5 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc52a3Q9D6X5 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc52a3Q9D6X5 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc52a3Q9D6X5 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc52a3Q9D6X5 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc52a3Q9D6X5 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc52a3Q9D6X5 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc52a3Q9D6X5 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc52a3Q9D6X5 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc52a3Q9D6X5 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc52a3Q9D6X5 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc52a3Q9D6X5 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc52a3Q9D6X5 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc52a3Q9D6X5 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc52a3Q9D6X5 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc52a3Q9D6X5 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc52a3Q9D6X5 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc52a3Q9D6X5 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc52a3Q9D6X5 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc52a3Q9D6X5 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc52a3Q9D6X5 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc52a3Q9D6X5 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc52a3Q9D6X5 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc52a3Q9D6X5 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc52a3Q9D6X5 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc52a3Q9D6X5 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc52a3Q9D6X5 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc52a3Q9D6X5 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc52a3Q9D6X5 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc52a3Q9D6X5 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc52a3Q9D6X5 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc52a3Q9D6X5 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc52a3Q9D6X5 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc52a3Q9D6X5 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc52a3Q9D6X5 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc52a3Q9D6X5 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc52a3Q9D6X5 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc52a3Q9D6X5 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc52a3Q9D6X5 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc52a3Q9D6X5 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc52a3Q9D6X5 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc52a3Q9D6X5 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc52a3Q9D6X5 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc52a3Q9D6X5 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc52a3Q9D6X5 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc52a3Q9D6X5 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc52a3Q9D6X5 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc52a3Q9D6X5 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms