Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6I0

Rtl8c, Cxx1c protein, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtl8cQ9D6I0 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rtl8cQ9D6I0 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Rtl8cQ9D6I0 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rtl8cQ9D6I0 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rtl8cQ9D6I0 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rtl8cQ9D6I0 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rtl8cQ9D6I0 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rtl8cQ9D6I0 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rtl8cQ9D6I0 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rtl8cQ9D6I0 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rtl8cQ9D6I0 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rtl8cQ9D6I0 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rtl8cQ9D6I0 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rtl8cQ9D6I0 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rtl8cQ9D6I0 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rtl8cQ9D6I0 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rtl8cQ9D6I0 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rtl8cQ9D6I0 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rtl8cQ9D6I0 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rtl8cQ9D6I0 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rtl8cQ9D6I0 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rtl8cQ9D6I0 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Rtl8cQ9D6I0 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rtl8cQ9D6I0 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Rtl8cQ9D6I0 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rtl8cQ9D6I0 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Rtl8cQ9D6I0 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rtl8cQ9D6I0 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Rtl8cQ9D6I0 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rtl8cQ9D6I0 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rtl8cQ9D6I0 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rtl8cQ9D6I0 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rtl8cQ9D6I0 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rtl8cQ9D6I0 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rtl8cQ9D6I0 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rtl8cQ9D6I0 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rtl8cQ9D6I0 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rtl8cQ9D6I0 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rtl8cQ9D6I0 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rtl8cQ9D6I0 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Rtl8cQ9D6I0 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rtl8cQ9D6I0 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rtl8cQ9D6I0 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rtl8cQ9D6I0 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rtl8cQ9D6I0 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rtl8cQ9D6I0 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rtl8cQ9D6I0 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rtl8cQ9D6I0 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rtl8cQ9D6I0 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rtl8cQ9D6I0 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rtl8cQ9D6I0 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rtl8cQ9D6I0 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rtl8cQ9D6I0 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rtl8cQ9D6I0 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rtl8cQ9D6I0 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rtl8cQ9D6I0 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rtl8cQ9D6I0 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rtl8cQ9D6I0 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rtl8cQ9D6I0 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rtl8cQ9D6I0 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rtl8cQ9D6I0 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rtl8cQ9D6I0 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rtl8cQ9D6I0 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rtl8cQ9D6I0 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rtl8cQ9D6I0 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rtl8cQ9D6I0 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rtl8cQ9D6I0 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rtl8cQ9D6I0 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rtl8cQ9D6I0 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rtl8cQ9D6I0 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rtl8cQ9D6I0 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rtl8cQ9D6I0 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rtl8cQ9D6I0 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rtl8cQ9D6I0 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rtl8cQ9D6I0 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rtl8cQ9D6I0 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rtl8cQ9D6I0 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rtl8cQ9D6I0 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rtl8cQ9D6I0 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rtl8cQ9D6I0 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rtl8cQ9D6I0 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rtl8cQ9D6I0 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rtl8cQ9D6I0 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rtl8cQ9D6I0 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rtl8cQ9D6I0 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rtl8cQ9D6I0 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rtl8cQ9D6I0 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rtl8cQ9D6I0 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rtl8cQ9D6I0 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rtl8cQ9D6I0 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rtl8cQ9D6I0 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rtl8cQ9D6I0 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rtl8cQ9D6I0 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rtl8cQ9D6I0 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Rtl8cQ9D6I0 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rtl8cQ9D6I0 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rtl8cQ9D6I0 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rtl8cQ9D6I0 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rtl8cQ9D6I0 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rtl8cQ9D6I0 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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