Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6G9

Cmtm5, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmtm5Q9D6G9 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cmtm5Q9D6G9 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cmtm5Q9D6G9 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cmtm5Q9D6G9 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cmtm5Q9D6G9 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cmtm5Q9D6G9 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cmtm5Q9D6G9 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cmtm5Q9D6G9 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cmtm5Q9D6G9 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cmtm5Q9D6G9 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cmtm5Q9D6G9 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cmtm5Q9D6G9 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cmtm5Q9D6G9 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cmtm5Q9D6G9 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cmtm5Q9D6G9 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Cmtm5Q9D6G9 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cmtm5Q9D6G9 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cmtm5Q9D6G9 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cmtm5Q9D6G9 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cmtm5Q9D6G9 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cmtm5Q9D6G9 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cmtm5Q9D6G9 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cmtm5Q9D6G9 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cmtm5Q9D6G9 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cmtm5Q9D6G9 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cmtm5Q9D6G9 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cmtm5Q9D6G9 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Cmtm5Q9D6G9 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cmtm5Q9D6G9 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cmtm5Q9D6G9 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cmtm5Q9D6G9 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cmtm5Q9D6G9 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cmtm5Q9D6G9 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cmtm5Q9D6G9 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cmtm5Q9D6G9 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cmtm5Q9D6G9 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cmtm5Q9D6G9 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cmtm5Q9D6G9 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cmtm5Q9D6G9 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cmtm5Q9D6G9 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cmtm5Q9D6G9 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cmtm5Q9D6G9 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cmtm5Q9D6G9 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cmtm5Q9D6G9 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cmtm5Q9D6G9 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cmtm5Q9D6G9 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cmtm5Q9D6G9 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cmtm5Q9D6G9 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cmtm5Q9D6G9 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cmtm5Q9D6G9 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cmtm5Q9D6G9 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cmtm5Q9D6G9 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cmtm5Q9D6G9 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cmtm5Q9D6G9 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cmtm5Q9D6G9 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cmtm5Q9D6G9 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cmtm5Q9D6G9 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cmtm5Q9D6G9 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cmtm5Q9D6G9 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cmtm5Q9D6G9 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cmtm5Q9D6G9 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cmtm5Q9D6G9 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cmtm5Q9D6G9 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cmtm5Q9D6G9 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cmtm5Q9D6G9 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cmtm5Q9D6G9 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cmtm5Q9D6G9 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cmtm5Q9D6G9 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cmtm5Q9D6G9 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cmtm5Q9D6G9 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cmtm5Q9D6G9 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cmtm5Q9D6G9 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cmtm5Q9D6G9 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cmtm5Q9D6G9 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cmtm5Q9D6G9 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cmtm5Q9D6G9 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cmtm5Q9D6G9 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cmtm5Q9D6G9 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cmtm5Q9D6G9 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cmtm5Q9D6G9 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cmtm5Q9D6G9 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cmtm5Q9D6G9 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Cmtm5Q9D6G9 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Cmtm5Q9D6G9 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cmtm5Q9D6G9 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cmtm5Q9D6G9 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cmtm5Q9D6G9 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cmtm5Q9D6G9 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cmtm5Q9D6G9 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cmtm5Q9D6G9 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cmtm5Q9D6G9 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cmtm5Q9D6G9 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cmtm5Q9D6G9 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cmtm5Q9D6G9 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cmtm5Q9D6G9 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cmtm5Q9D6G9 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cmtm5Q9D6G9 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cmtm5Q9D6G9 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cmtm5Q9D6G9 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cmtm5Q9D6G9 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms