Protein–RNA interactions for Protein: Q9D658

Ptp4a3, Protein tyrosine phosphatase type IVA 3, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptp4a3Q9D658 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Ptp4a3Q9D658 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ptp4a3Q9D658 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ptp4a3Q9D658 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ptp4a3Q9D658 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ptp4a3Q9D658 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ptp4a3Q9D658 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ptp4a3Q9D658 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ptp4a3Q9D658 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ptp4a3Q9D658 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ptp4a3Q9D658 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ptp4a3Q9D658 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Ptp4a3Q9D658 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ptp4a3Q9D658 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ptp4a3Q9D658 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Ptp4a3Q9D658 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ptp4a3Q9D658 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ptp4a3Q9D658 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ptp4a3Q9D658 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Ptp4a3Q9D658 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Ptp4a3Q9D658 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ptp4a3Q9D658 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ptp4a3Q9D658 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ptp4a3Q9D658 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ptp4a3Q9D658 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ptp4a3Q9D658 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ptp4a3Q9D658 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Ptp4a3Q9D658 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ptp4a3Q9D658 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Ptp4a3Q9D658 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Ptp4a3Q9D658 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Ptp4a3Q9D658 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ptp4a3Q9D658 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Ptp4a3Q9D658 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Ptp4a3Q9D658 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Ptp4a3Q9D658 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Ptp4a3Q9D658 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ptp4a3Q9D658 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Ptp4a3Q9D658 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ptp4a3Q9D658 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Ptp4a3Q9D658 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Ptp4a3Q9D658 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ptp4a3Q9D658 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ptp4a3Q9D658 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ptp4a3Q9D658 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ptp4a3Q9D658 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ptp4a3Q9D658 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ptp4a3Q9D658 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ptp4a3Q9D658 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ptp4a3Q9D658 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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