Protein–RNA interactions for Protein: Q9D620

Rab11fip1, Rab11 family-interacting protein 1, mousemouse

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Length 645 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11fip1Q9D620 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rab11fip1Q9D620 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rab11fip1Q9D620 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rab11fip1Q9D620 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rab11fip1Q9D620 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rab11fip1Q9D620 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rab11fip1Q9D620 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rab11fip1Q9D620 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rab11fip1Q9D620 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rab11fip1Q9D620 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rab11fip1Q9D620 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rab11fip1Q9D620 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rab11fip1Q9D620 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rab11fip1Q9D620 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rab11fip1Q9D620 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rab11fip1Q9D620 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rab11fip1Q9D620 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rab11fip1Q9D620 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rab11fip1Q9D620 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rab11fip1Q9D620 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rab11fip1Q9D620 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rab11fip1Q9D620 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Rab11fip1Q9D620 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Rab11fip1Q9D620 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rab11fip1Q9D620 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rab11fip1Q9D620 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Rab11fip1Q9D620 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Rab11fip1Q9D620 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Rab11fip1Q9D620 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Rab11fip1Q9D620 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Rab11fip1Q9D620 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Rab11fip1Q9D620 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rab11fip1Q9D620 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rab11fip1Q9D620 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rab11fip1Q9D620 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rab11fip1Q9D620 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rab11fip1Q9D620 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rab11fip1Q9D620 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rab11fip1Q9D620 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rab11fip1Q9D620 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rab11fip1Q9D620 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rab11fip1Q9D620 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rab11fip1Q9D620 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rab11fip1Q9D620 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Rab11fip1Q9D620 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Rab11fip1Q9D620 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rab11fip1Q9D620 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rab11fip1Q9D620 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rab11fip1Q9D620 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Rab11fip1Q9D620 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rab11fip1Q9D620 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rab11fip1Q9D620 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rab11fip1Q9D620 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rab11fip1Q9D620 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rab11fip1Q9D620 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rab11fip1Q9D620 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rab11fip1Q9D620 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rab11fip1Q9D620 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rab11fip1Q9D620 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rab11fip1Q9D620 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rab11fip1Q9D620 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rab11fip1Q9D620 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rab11fip1Q9D620 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rab11fip1Q9D620 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rab11fip1Q9D620 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rab11fip1Q9D620 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rab11fip1Q9D620 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rab11fip1Q9D620 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Rab11fip1Q9D620 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rab11fip1Q9D620 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rab11fip1Q9D620 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Rab11fip1Q9D620 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rab11fip1Q9D620 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rab11fip1Q9D620 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rab11fip1Q9D620 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rab11fip1Q9D620 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rab11fip1Q9D620 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rab11fip1Q9D620 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rab11fip1Q9D620 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rab11fip1Q9D620 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rab11fip1Q9D620 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rab11fip1Q9D620 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rab11fip1Q9D620 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rab11fip1Q9D620 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rab11fip1Q9D620 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rab11fip1Q9D620 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rab11fip1Q9D620 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rab11fip1Q9D620 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rab11fip1Q9D620 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rab11fip1Q9D620 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rab11fip1Q9D620 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rab11fip1Q9D620 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rab11fip1Q9D620 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Rab11fip1Q9D620 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rab11fip1Q9D620 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rab11fip1Q9D620 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rab11fip1Q9D620 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rab11fip1Q9D620 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rab11fip1Q9D620 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rab11fip1Q9D620 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
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