Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5Y1

Ccdc39, Coiled-coil domain-containing protein 39, mousemouse

Predictions only

Length 937 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc39Q9D5Y1 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc39Q9D5Y1 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc39Q9D5Y1 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc39Q9D5Y1 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc39Q9D5Y1 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc39Q9D5Y1 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc39Q9D5Y1 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc39Q9D5Y1 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc39Q9D5Y1 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc39Q9D5Y1 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc39Q9D5Y1 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc39Q9D5Y1 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc39Q9D5Y1 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc39Q9D5Y1 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc39Q9D5Y1 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc39Q9D5Y1 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc39Q9D5Y1 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc39Q9D5Y1 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc39Q9D5Y1 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc39Q9D5Y1 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc39Q9D5Y1 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc39Q9D5Y1 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc39Q9D5Y1 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc39Q9D5Y1 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc39Q9D5Y1 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc39Q9D5Y1 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc39Q9D5Y1 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc39Q9D5Y1 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc39Q9D5Y1 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc39Q9D5Y1 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc39Q9D5Y1 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc39Q9D5Y1 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc39Q9D5Y1 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc39Q9D5Y1 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc39Q9D5Y1 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc39Q9D5Y1 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc39Q9D5Y1 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc39Q9D5Y1 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc39Q9D5Y1 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc39Q9D5Y1 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc39Q9D5Y1 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc39Q9D5Y1 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc39Q9D5Y1 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc39Q9D5Y1 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc39Q9D5Y1 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc39Q9D5Y1 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc39Q9D5Y1 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc39Q9D5Y1 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc39Q9D5Y1 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc39Q9D5Y1 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc39Q9D5Y1 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc39Q9D5Y1 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc39Q9D5Y1 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc39Q9D5Y1 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc39Q9D5Y1 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc39Q9D5Y1 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc39Q9D5Y1 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc39Q9D5Y1 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc39Q9D5Y1 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc39Q9D5Y1 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc39Q9D5Y1 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc39Q9D5Y1 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc39Q9D5Y1 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc39Q9D5Y1 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc39Q9D5Y1 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc39Q9D5Y1 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc39Q9D5Y1 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc39Q9D5Y1 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc39Q9D5Y1 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc39Q9D5Y1 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc39Q9D5Y1 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc39Q9D5Y1 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc39Q9D5Y1 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc39Q9D5Y1 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc39Q9D5Y1 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc39Q9D5Y1 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc39Q9D5Y1 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc39Q9D5Y1 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc39Q9D5Y1 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc39Q9D5Y1 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc39Q9D5Y1 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc39Q9D5Y1 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc39Q9D5Y1 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc39Q9D5Y1 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc39Q9D5Y1 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc39Q9D5Y1 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc39Q9D5Y1 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc39Q9D5Y1 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc39Q9D5Y1 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc39Q9D5Y1 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc39Q9D5Y1 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc39Q9D5Y1 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc39Q9D5Y1 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc39Q9D5Y1 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc39Q9D5Y1 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc39Q9D5Y1 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc39Q9D5Y1 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc39Q9D5Y1 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc39Q9D5Y1 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc39Q9D5Y1 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms