Protein–RNA interactions for Protein: Q9D518

Fam227b, Protein FAM227B, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam227bQ9D518 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
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Fam227bQ9D518 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Fam227bQ9D518 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Fam227bQ9D518 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Fam227bQ9D518 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
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Fam227bQ9D518 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Fam227bQ9D518 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Fam227bQ9D518 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
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Fam227bQ9D518 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Fam227bQ9D518 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
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Fam227bQ9D518 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
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Fam227bQ9D518 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
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Fam227bQ9D518 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
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Fam227bQ9D518 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Fam227bQ9D518 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
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Fam227bQ9D518 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Fam227bQ9D518 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
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Fam227bQ9D518 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Fam227bQ9D518 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
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Fam227bQ9D518 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Fam227bQ9D518 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Fam227bQ9D518 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
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Fam227bQ9D518 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
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Fam227bQ9D518 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fam227bQ9D518 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fam227bQ9D518 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fam227bQ9D518 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fam227bQ9D518 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
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Fam227bQ9D518 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
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Fam227bQ9D518 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fam227bQ9D518 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fam227bQ9D518 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fam227bQ9D518 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fam227bQ9D518 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fam227bQ9D518 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Fam227bQ9D518 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fam227bQ9D518 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fam227bQ9D518 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fam227bQ9D518 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fam227bQ9D518 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fam227bQ9D518 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fam227bQ9D518 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fam227bQ9D518 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fam227bQ9D518 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fam227bQ9D518 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fam227bQ9D518 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fam227bQ9D518 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fam227bQ9D518 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fam227bQ9D518 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
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