Protein–RNA interactions for Protein: Q9D516

Ccdc130, Coiled-coil domain-containing protein 130, mousemouse

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc130Q9D516 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc130Q9D516 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc130Q9D516 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc130Q9D516 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc130Q9D516 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc130Q9D516 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc130Q9D516 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc130Q9D516 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc130Q9D516 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc130Q9D516 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc130Q9D516 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc130Q9D516 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc130Q9D516 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc130Q9D516 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc130Q9D516 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc130Q9D516 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc130Q9D516 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc130Q9D516 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc130Q9D516 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc130Q9D516 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc130Q9D516 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc130Q9D516 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc130Q9D516 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc130Q9D516 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc130Q9D516 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc130Q9D516 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc130Q9D516 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc130Q9D516 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc130Q9D516 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc130Q9D516 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc130Q9D516 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc130Q9D516 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc130Q9D516 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc130Q9D516 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc130Q9D516 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc130Q9D516 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc130Q9D516 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc130Q9D516 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc130Q9D516 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc130Q9D516 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc130Q9D516 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc130Q9D516 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc130Q9D516 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc130Q9D516 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc130Q9D516 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc130Q9D516 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc130Q9D516 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc130Q9D516 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc130Q9D516 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc130Q9D516 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc130Q9D516 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc130Q9D516 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc130Q9D516 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc130Q9D516 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc130Q9D516 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc130Q9D516 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc130Q9D516 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc130Q9D516 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc130Q9D516 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc130Q9D516 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc130Q9D516 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc130Q9D516 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc130Q9D516 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc130Q9D516 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc130Q9D516 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc130Q9D516 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc130Q9D516 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc130Q9D516 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc130Q9D516 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc130Q9D516 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc130Q9D516 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc130Q9D516 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc130Q9D516 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc130Q9D516 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc130Q9D516 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc130Q9D516 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc130Q9D516 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc130Q9D516 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc130Q9D516 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc130Q9D516 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc130Q9D516 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc130Q9D516 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc130Q9D516 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc130Q9D516 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc130Q9D516 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc130Q9D516 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc130Q9D516 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc130Q9D516 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc130Q9D516 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc130Q9D516 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc130Q9D516 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc130Q9D516 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc130Q9D516 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc130Q9D516 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc130Q9D516 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc130Q9D516 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc130Q9D516 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc130Q9D516 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc130Q9D516 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc130Q9D516 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms