Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4Z5

Prame, Preferentially-expressed antigen in melanoma, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrameQ9D4Z5 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
PrameQ9D4Z5 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PrameQ9D4Z5 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PrameQ9D4Z5 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PrameQ9D4Z5 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PrameQ9D4Z5 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PrameQ9D4Z5 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PrameQ9D4Z5 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PrameQ9D4Z5 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PrameQ9D4Z5 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PrameQ9D4Z5 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PrameQ9D4Z5 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PrameQ9D4Z5 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PrameQ9D4Z5 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PrameQ9D4Z5 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PrameQ9D4Z5 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PrameQ9D4Z5 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PrameQ9D4Z5 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PrameQ9D4Z5 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PrameQ9D4Z5 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PrameQ9D4Z5 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PrameQ9D4Z5 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
PrameQ9D4Z5 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PrameQ9D4Z5 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PrameQ9D4Z5 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PrameQ9D4Z5 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PrameQ9D4Z5 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PrameQ9D4Z5 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PrameQ9D4Z5 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PrameQ9D4Z5 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PrameQ9D4Z5 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PrameQ9D4Z5 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PrameQ9D4Z5 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PrameQ9D4Z5 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PrameQ9D4Z5 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PrameQ9D4Z5 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PrameQ9D4Z5 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PrameQ9D4Z5 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PrameQ9D4Z5 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PrameQ9D4Z5 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PrameQ9D4Z5 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PrameQ9D4Z5 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PrameQ9D4Z5 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PrameQ9D4Z5 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PrameQ9D4Z5 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PrameQ9D4Z5 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PrameQ9D4Z5 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PrameQ9D4Z5 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PrameQ9D4Z5 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PrameQ9D4Z5 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PrameQ9D4Z5 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PrameQ9D4Z5 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PrameQ9D4Z5 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PrameQ9D4Z5 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PrameQ9D4Z5 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PrameQ9D4Z5 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PrameQ9D4Z5 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PrameQ9D4Z5 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PrameQ9D4Z5 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PrameQ9D4Z5 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PrameQ9D4Z5 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PrameQ9D4Z5 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PrameQ9D4Z5 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PrameQ9D4Z5 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PrameQ9D4Z5 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PrameQ9D4Z5 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PrameQ9D4Z5 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PrameQ9D4Z5 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PrameQ9D4Z5 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PrameQ9D4Z5 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PrameQ9D4Z5 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PrameQ9D4Z5 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PrameQ9D4Z5 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PrameQ9D4Z5 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
PrameQ9D4Z5 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PrameQ9D4Z5 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PrameQ9D4Z5 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PrameQ9D4Z5 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PrameQ9D4Z5 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PrameQ9D4Z5 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PrameQ9D4Z5 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PrameQ9D4Z5 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PrameQ9D4Z5 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PrameQ9D4Z5 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PrameQ9D4Z5 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PrameQ9D4Z5 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PrameQ9D4Z5 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PrameQ9D4Z5 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PrameQ9D4Z5 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PrameQ9D4Z5 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PrameQ9D4Z5 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PrameQ9D4Z5 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PrameQ9D4Z5 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PrameQ9D4Z5 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PrameQ9D4Z5 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PrameQ9D4Z5 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PrameQ9D4Z5 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PrameQ9D4Z5 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PrameQ9D4Z5 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PrameQ9D4Z5 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74 ms