Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4K7

Ccdc105, Coiled-coil domain-containing protein 105, mousemouse

Predictions only

Length 499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc105Q9D4K7 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc105Q9D4K7 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc105Q9D4K7 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc105Q9D4K7 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc105Q9D4K7 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc105Q9D4K7 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc105Q9D4K7 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc105Q9D4K7 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc105Q9D4K7 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc105Q9D4K7 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc105Q9D4K7 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc105Q9D4K7 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc105Q9D4K7 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc105Q9D4K7 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc105Q9D4K7 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc105Q9D4K7 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc105Q9D4K7 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc105Q9D4K7 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc105Q9D4K7 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc105Q9D4K7 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc105Q9D4K7 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc105Q9D4K7 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc105Q9D4K7 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc105Q9D4K7 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc105Q9D4K7 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc105Q9D4K7 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc105Q9D4K7 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc105Q9D4K7 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc105Q9D4K7 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc105Q9D4K7 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc105Q9D4K7 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc105Q9D4K7 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc105Q9D4K7 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc105Q9D4K7 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc105Q9D4K7 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc105Q9D4K7 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Ccdc105Q9D4K7 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
Ccdc105Q9D4K7 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Ccdc105Q9D4K7 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc105Q9D4K7 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc105Q9D4K7 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc105Q9D4K7 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc105Q9D4K7 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc105Q9D4K7 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc105Q9D4K7 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc105Q9D4K7 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc105Q9D4K7 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc105Q9D4K7 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc105Q9D4K7 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc105Q9D4K7 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc105Q9D4K7 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc105Q9D4K7 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc105Q9D4K7 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc105Q9D4K7 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc105Q9D4K7 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc105Q9D4K7 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc105Q9D4K7 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc105Q9D4K7 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc105Q9D4K7 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc105Q9D4K7 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc105Q9D4K7 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc105Q9D4K7 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc105Q9D4K7 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc105Q9D4K7 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc105Q9D4K7 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc105Q9D4K7 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc105Q9D4K7 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc105Q9D4K7 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc105Q9D4K7 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc105Q9D4K7 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc105Q9D4K7 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc105Q9D4K7 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc105Q9D4K7 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc105Q9D4K7 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc105Q9D4K7 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc105Q9D4K7 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc105Q9D4K7 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc105Q9D4K7 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc105Q9D4K7 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc105Q9D4K7 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc105Q9D4K7 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc105Q9D4K7 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc105Q9D4K7 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc105Q9D4K7 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc105Q9D4K7 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc105Q9D4K7 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc105Q9D4K7 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc105Q9D4K7 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc105Q9D4K7 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc105Q9D4K7 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc105Q9D4K7 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc105Q9D4K7 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc105Q9D4K7 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc105Q9D4K7 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc105Q9D4K7 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc105Q9D4K7 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc105Q9D4K7 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc105Q9D4K7 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc105Q9D4K7 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc105Q9D4K7 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms