Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4J9

4931423N10Rik, MCG52616, mousemouse

Predictions only

Length 382 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4931423N10RikQ9D4J9 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
4931423N10RikQ9D4J9 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
4931423N10RikQ9D4J9 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
4931423N10RikQ9D4J9 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
4931423N10RikQ9D4J9 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
4931423N10RikQ9D4J9 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
4931423N10RikQ9D4J9 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
4931423N10RikQ9D4J9 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
4931423N10RikQ9D4J9 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
4931423N10RikQ9D4J9 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
4931423N10RikQ9D4J9 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
4931423N10RikQ9D4J9 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
4931423N10RikQ9D4J9 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
4931423N10RikQ9D4J9 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
4931423N10RikQ9D4J9 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
4931423N10RikQ9D4J9 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
4931423N10RikQ9D4J9 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
4931423N10RikQ9D4J9 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
4931423N10RikQ9D4J9 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
4931423N10RikQ9D4J9 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
4931423N10RikQ9D4J9 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
4931423N10RikQ9D4J9 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
4931423N10RikQ9D4J9 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
4931423N10RikQ9D4J9 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
4931423N10RikQ9D4J9 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
4931423N10RikQ9D4J9 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
4931423N10RikQ9D4J9 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
4931423N10RikQ9D4J9 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
4931423N10RikQ9D4J9 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
4931423N10RikQ9D4J9 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
4931423N10RikQ9D4J9 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
4931423N10RikQ9D4J9 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
4931423N10RikQ9D4J9 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
4931423N10RikQ9D4J9 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
4931423N10RikQ9D4J9 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
4931423N10RikQ9D4J9 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
4931423N10RikQ9D4J9 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
4931423N10RikQ9D4J9 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
4931423N10RikQ9D4J9 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
4931423N10RikQ9D4J9 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
4931423N10RikQ9D4J9 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
4931423N10RikQ9D4J9 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
4931423N10RikQ9D4J9 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
4931423N10RikQ9D4J9 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
4931423N10RikQ9D4J9 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
4931423N10RikQ9D4J9 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
4931423N10RikQ9D4J9 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
4931423N10RikQ9D4J9 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
4931423N10RikQ9D4J9 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
4931423N10RikQ9D4J9 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
4931423N10RikQ9D4J9 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
4931423N10RikQ9D4J9 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
4931423N10RikQ9D4J9 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
4931423N10RikQ9D4J9 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
4931423N10RikQ9D4J9 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
4931423N10RikQ9D4J9 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
4931423N10RikQ9D4J9 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
4931423N10RikQ9D4J9 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
4931423N10RikQ9D4J9 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
4931423N10RikQ9D4J9 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
4931423N10RikQ9D4J9 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
4931423N10RikQ9D4J9 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
4931423N10RikQ9D4J9 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
4931423N10RikQ9D4J9 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
4931423N10RikQ9D4J9 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
4931423N10RikQ9D4J9 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
4931423N10RikQ9D4J9 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
4931423N10RikQ9D4J9 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
4931423N10RikQ9D4J9 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
4931423N10RikQ9D4J9 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
4931423N10RikQ9D4J9 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
4931423N10RikQ9D4J9 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
4931423N10RikQ9D4J9 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
4931423N10RikQ9D4J9 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
4931423N10RikQ9D4J9 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
4931423N10RikQ9D4J9 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
4931423N10RikQ9D4J9 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
4931423N10RikQ9D4J9 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
4931423N10RikQ9D4J9 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
4931423N10RikQ9D4J9 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
4931423N10RikQ9D4J9 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
4931423N10RikQ9D4J9 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
4931423N10RikQ9D4J9 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
4931423N10RikQ9D4J9 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
4931423N10RikQ9D4J9 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
4931423N10RikQ9D4J9 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
4931423N10RikQ9D4J9 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
4931423N10RikQ9D4J9 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
4931423N10RikQ9D4J9 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
4931423N10RikQ9D4J9 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
4931423N10RikQ9D4J9 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
4931423N10RikQ9D4J9 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
4931423N10RikQ9D4J9 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
4931423N10RikQ9D4J9 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
4931423N10RikQ9D4J9 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
4931423N10RikQ9D4J9 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
4931423N10RikQ9D4J9 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
4931423N10RikQ9D4J9 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
4931423N10RikQ9D4J9 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
4931423N10RikQ9D4J9 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.1 ms