Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4J7

Phf6, PHD finger protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf6Q9D4J7 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Phf6Q9D4J7 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Phf6Q9D4J7 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Phf6Q9D4J7 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Phf6Q9D4J7 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Phf6Q9D4J7 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Phf6Q9D4J7 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Phf6Q9D4J7 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Phf6Q9D4J7 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Phf6Q9D4J7 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Phf6Q9D4J7 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Phf6Q9D4J7 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Phf6Q9D4J7 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Phf6Q9D4J7 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Phf6Q9D4J7 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Phf6Q9D4J7 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Phf6Q9D4J7 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Phf6Q9D4J7 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Phf6Q9D4J7 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Phf6Q9D4J7 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Phf6Q9D4J7 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Phf6Q9D4J7 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Phf6Q9D4J7 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Phf6Q9D4J7 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Phf6Q9D4J7 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Phf6Q9D4J7 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Phf6Q9D4J7 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Phf6Q9D4J7 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Phf6Q9D4J7 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Phf6Q9D4J7 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Phf6Q9D4J7 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Phf6Q9D4J7 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Phf6Q9D4J7 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Phf6Q9D4J7 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Phf6Q9D4J7 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Phf6Q9D4J7 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Phf6Q9D4J7 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Phf6Q9D4J7 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Phf6Q9D4J7 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Phf6Q9D4J7 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Phf6Q9D4J7 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Phf6Q9D4J7 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Phf6Q9D4J7 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Phf6Q9D4J7 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Phf6Q9D4J7 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Phf6Q9D4J7 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Phf6Q9D4J7 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Phf6Q9D4J7 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Phf6Q9D4J7 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Phf6Q9D4J7 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Phf6Q9D4J7 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Phf6Q9D4J7 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Phf6Q9D4J7 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Phf6Q9D4J7 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Phf6Q9D4J7 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Phf6Q9D4J7 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Phf6Q9D4J7 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Phf6Q9D4J7 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Phf6Q9D4J7 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Phf6Q9D4J7 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Phf6Q9D4J7 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Phf6Q9D4J7 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Phf6Q9D4J7 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Phf6Q9D4J7 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Phf6Q9D4J7 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Phf6Q9D4J7 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Phf6Q9D4J7 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Phf6Q9D4J7 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Phf6Q9D4J7 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Phf6Q9D4J7 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Phf6Q9D4J7 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Phf6Q9D4J7 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Phf6Q9D4J7 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Phf6Q9D4J7 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Phf6Q9D4J7 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Phf6Q9D4J7 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Phf6Q9D4J7 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Phf6Q9D4J7 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Phf6Q9D4J7 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Phf6Q9D4J7 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Phf6Q9D4J7 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Phf6Q9D4J7 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Phf6Q9D4J7 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Phf6Q9D4J7 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Phf6Q9D4J7 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Phf6Q9D4J7 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Phf6Q9D4J7 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Phf6Q9D4J7 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Phf6Q9D4J7 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Phf6Q9D4J7 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Phf6Q9D4J7 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Phf6Q9D4J7 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Phf6Q9D4J7 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Phf6Q9D4J7 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Phf6Q9D4J7 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Phf6Q9D4J7 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Phf6Q9D4J7 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Phf6Q9D4J7 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Phf6Q9D4J7 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Phf6Q9D4J7 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.7 ms