Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4F3

Fam90a1b, Family with sequence similarity 90, member A1B, mousemouse

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam90a1bQ9D4F3 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fam90a1bQ9D4F3 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fam90a1bQ9D4F3 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fam90a1bQ9D4F3 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fam90a1bQ9D4F3 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fam90a1bQ9D4F3 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fam90a1bQ9D4F3 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fam90a1bQ9D4F3 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fam90a1bQ9D4F3 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fam90a1bQ9D4F3 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fam90a1bQ9D4F3 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fam90a1bQ9D4F3 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fam90a1bQ9D4F3 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fam90a1bQ9D4F3 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fam90a1bQ9D4F3 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fam90a1bQ9D4F3 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fam90a1bQ9D4F3 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fam90a1bQ9D4F3 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fam90a1bQ9D4F3 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Fam90a1bQ9D4F3 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Fam90a1bQ9D4F3 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fam90a1bQ9D4F3 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fam90a1bQ9D4F3 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fam90a1bQ9D4F3 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fam90a1bQ9D4F3 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Fam90a1bQ9D4F3 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fam90a1bQ9D4F3 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fam90a1bQ9D4F3 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fam90a1bQ9D4F3 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fam90a1bQ9D4F3 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fam90a1bQ9D4F3 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fam90a1bQ9D4F3 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fam90a1bQ9D4F3 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fam90a1bQ9D4F3 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fam90a1bQ9D4F3 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fam90a1bQ9D4F3 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fam90a1bQ9D4F3 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fam90a1bQ9D4F3 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fam90a1bQ9D4F3 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fam90a1bQ9D4F3 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fam90a1bQ9D4F3 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fam90a1bQ9D4F3 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fam90a1bQ9D4F3 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fam90a1bQ9D4F3 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fam90a1bQ9D4F3 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Fam90a1bQ9D4F3 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fam90a1bQ9D4F3 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fam90a1bQ9D4F3 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fam90a1bQ9D4F3 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fam90a1bQ9D4F3 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fam90a1bQ9D4F3 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fam90a1bQ9D4F3 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fam90a1bQ9D4F3 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fam90a1bQ9D4F3 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fam90a1bQ9D4F3 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fam90a1bQ9D4F3 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Fam90a1bQ9D4F3 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fam90a1bQ9D4F3 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fam90a1bQ9D4F3 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fam90a1bQ9D4F3 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fam90a1bQ9D4F3 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fam90a1bQ9D4F3 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fam90a1bQ9D4F3 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fam90a1bQ9D4F3 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fam90a1bQ9D4F3 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fam90a1bQ9D4F3 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Fam90a1bQ9D4F3 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fam90a1bQ9D4F3 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fam90a1bQ9D4F3 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fam90a1bQ9D4F3 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fam90a1bQ9D4F3 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fam90a1bQ9D4F3 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fam90a1bQ9D4F3 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fam90a1bQ9D4F3 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Fam90a1bQ9D4F3 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fam90a1bQ9D4F3 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fam90a1bQ9D4F3 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fam90a1bQ9D4F3 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fam90a1bQ9D4F3 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fam90a1bQ9D4F3 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fam90a1bQ9D4F3 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Fam90a1bQ9D4F3 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fam90a1bQ9D4F3 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fam90a1bQ9D4F3 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fam90a1bQ9D4F3 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fam90a1bQ9D4F3 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fam90a1bQ9D4F3 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fam90a1bQ9D4F3 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fam90a1bQ9D4F3 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fam90a1bQ9D4F3 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fam90a1bQ9D4F3 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fam90a1bQ9D4F3 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fam90a1bQ9D4F3 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Fam90a1bQ9D4F3 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fam90a1bQ9D4F3 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fam90a1bQ9D4F3 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fam90a1bQ9D4F3 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Fam90a1bQ9D4F3 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fam90a1bQ9D4F3 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fam90a1bQ9D4F3 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms