Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3Z8

4933425L06Rik, RIKEN cDNA 4933425L06, mousemouse

Predictions only

Length 585 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933425L06RikQ9D3Z8 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
4933425L06RikQ9D3Z8 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
4933425L06RikQ9D3Z8 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
4933425L06RikQ9D3Z8 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
4933425L06RikQ9D3Z8 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
4933425L06RikQ9D3Z8 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
4933425L06RikQ9D3Z8 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
4933425L06RikQ9D3Z8 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
4933425L06RikQ9D3Z8 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
4933425L06RikQ9D3Z8 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
4933425L06RikQ9D3Z8 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
4933425L06RikQ9D3Z8 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
4933425L06RikQ9D3Z8 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
4933425L06RikQ9D3Z8 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
4933425L06RikQ9D3Z8 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
4933425L06RikQ9D3Z8 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
4933425L06RikQ9D3Z8 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
4933425L06RikQ9D3Z8 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
4933425L06RikQ9D3Z8 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
4933425L06RikQ9D3Z8 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
4933425L06RikQ9D3Z8 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
4933425L06RikQ9D3Z8 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
4933425L06RikQ9D3Z8 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
4933425L06RikQ9D3Z8 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
4933425L06RikQ9D3Z8 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
4933425L06RikQ9D3Z8 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
4933425L06RikQ9D3Z8 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
4933425L06RikQ9D3Z8 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
4933425L06RikQ9D3Z8 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
4933425L06RikQ9D3Z8 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
4933425L06RikQ9D3Z8 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
4933425L06RikQ9D3Z8 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
4933425L06RikQ9D3Z8 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
4933425L06RikQ9D3Z8 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
4933425L06RikQ9D3Z8 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
4933425L06RikQ9D3Z8 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
4933425L06RikQ9D3Z8 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
4933425L06RikQ9D3Z8 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
4933425L06RikQ9D3Z8 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
4933425L06RikQ9D3Z8 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
4933425L06RikQ9D3Z8 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
4933425L06RikQ9D3Z8 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
4933425L06RikQ9D3Z8 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
4933425L06RikQ9D3Z8 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
4933425L06RikQ9D3Z8 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
4933425L06RikQ9D3Z8 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
4933425L06RikQ9D3Z8 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
4933425L06RikQ9D3Z8 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
4933425L06RikQ9D3Z8 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
4933425L06RikQ9D3Z8 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
4933425L06RikQ9D3Z8 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
4933425L06RikQ9D3Z8 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
4933425L06RikQ9D3Z8 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
4933425L06RikQ9D3Z8 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
4933425L06RikQ9D3Z8 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
4933425L06RikQ9D3Z8 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
4933425L06RikQ9D3Z8 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
4933425L06RikQ9D3Z8 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
4933425L06RikQ9D3Z8 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
4933425L06RikQ9D3Z8 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
4933425L06RikQ9D3Z8 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
4933425L06RikQ9D3Z8 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
4933425L06RikQ9D3Z8 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
4933425L06RikQ9D3Z8 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
4933425L06RikQ9D3Z8 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
4933425L06RikQ9D3Z8 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
4933425L06RikQ9D3Z8 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
4933425L06RikQ9D3Z8 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
4933425L06RikQ9D3Z8 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
4933425L06RikQ9D3Z8 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
4933425L06RikQ9D3Z8 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
4933425L06RikQ9D3Z8 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
4933425L06RikQ9D3Z8 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
4933425L06RikQ9D3Z8 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
4933425L06RikQ9D3Z8 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
4933425L06RikQ9D3Z8 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
4933425L06RikQ9D3Z8 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
4933425L06RikQ9D3Z8 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
4933425L06RikQ9D3Z8 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
4933425L06RikQ9D3Z8 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
4933425L06RikQ9D3Z8 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
4933425L06RikQ9D3Z8 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
4933425L06RikQ9D3Z8 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
4933425L06RikQ9D3Z8 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
4933425L06RikQ9D3Z8 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
4933425L06RikQ9D3Z8 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
4933425L06RikQ9D3Z8 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
4933425L06RikQ9D3Z8 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
4933425L06RikQ9D3Z8 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
4933425L06RikQ9D3Z8 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms