Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3W1

Rsph14, Radial spoke head 14 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsph14Q9D3W1 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rsph14Q9D3W1 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rsph14Q9D3W1 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rsph14Q9D3W1 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rsph14Q9D3W1 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rsph14Q9D3W1 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rsph14Q9D3W1 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rsph14Q9D3W1 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rsph14Q9D3W1 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rsph14Q9D3W1 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rsph14Q9D3W1 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rsph14Q9D3W1 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rsph14Q9D3W1 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rsph14Q9D3W1 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rsph14Q9D3W1 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rsph14Q9D3W1 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rsph14Q9D3W1 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rsph14Q9D3W1 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rsph14Q9D3W1 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rsph14Q9D3W1 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rsph14Q9D3W1 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rsph14Q9D3W1 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rsph14Q9D3W1 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rsph14Q9D3W1 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rsph14Q9D3W1 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rsph14Q9D3W1 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Rsph14Q9D3W1 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rsph14Q9D3W1 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rsph14Q9D3W1 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rsph14Q9D3W1 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rsph14Q9D3W1 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rsph14Q9D3W1 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rsph14Q9D3W1 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rsph14Q9D3W1 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rsph14Q9D3W1 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rsph14Q9D3W1 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rsph14Q9D3W1 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rsph14Q9D3W1 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rsph14Q9D3W1 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rsph14Q9D3W1 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rsph14Q9D3W1 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rsph14Q9D3W1 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rsph14Q9D3W1 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rsph14Q9D3W1 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rsph14Q9D3W1 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rsph14Q9D3W1 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rsph14Q9D3W1 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rsph14Q9D3W1 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rsph14Q9D3W1 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rsph14Q9D3W1 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rsph14Q9D3W1 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rsph14Q9D3W1 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rsph14Q9D3W1 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rsph14Q9D3W1 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rsph14Q9D3W1 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rsph14Q9D3W1 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rsph14Q9D3W1 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rsph14Q9D3W1 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rsph14Q9D3W1 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rsph14Q9D3W1 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rsph14Q9D3W1 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rsph14Q9D3W1 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rsph14Q9D3W1 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rsph14Q9D3W1 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rsph14Q9D3W1 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rsph14Q9D3W1 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rsph14Q9D3W1 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rsph14Q9D3W1 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rsph14Q9D3W1 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rsph14Q9D3W1 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rsph14Q9D3W1 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rsph14Q9D3W1 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rsph14Q9D3W1 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rsph14Q9D3W1 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rsph14Q9D3W1 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rsph14Q9D3W1 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rsph14Q9D3W1 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rsph14Q9D3W1 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rsph14Q9D3W1 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rsph14Q9D3W1 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rsph14Q9D3W1 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rsph14Q9D3W1 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rsph14Q9D3W1 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rsph14Q9D3W1 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rsph14Q9D3W1 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rsph14Q9D3W1 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rsph14Q9D3W1 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rsph14Q9D3W1 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Rsph14Q9D3W1 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rsph14Q9D3W1 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rsph14Q9D3W1 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rsph14Q9D3W1 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rsph14Q9D3W1 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rsph14Q9D3W1 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rsph14Q9D3W1 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rsph14Q9D3W1 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rsph14Q9D3W1 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rsph14Q9D3W1 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rsph14Q9D3W1 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rsph14Q9D3W1 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms