Protein–RNA interactions for Protein: Q9D394

Rufy3, Protein RUFY3, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rufy3Q9D394 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rufy3Q9D394 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rufy3Q9D394 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rufy3Q9D394 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rufy3Q9D394 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rufy3Q9D394 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rufy3Q9D394 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rufy3Q9D394 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rufy3Q9D394 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Rufy3Q9D394 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rufy3Q9D394 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rufy3Q9D394 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rufy3Q9D394 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rufy3Q9D394 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rufy3Q9D394 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rufy3Q9D394 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rufy3Q9D394 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rufy3Q9D394 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rufy3Q9D394 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Rufy3Q9D394 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rufy3Q9D394 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rufy3Q9D394 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rufy3Q9D394 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rufy3Q9D394 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rufy3Q9D394 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Rufy3Q9D394 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rufy3Q9D394 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rufy3Q9D394 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rufy3Q9D394 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rufy3Q9D394 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Rufy3Q9D394 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rufy3Q9D394 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rufy3Q9D394 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rufy3Q9D394 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rufy3Q9D394 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rufy3Q9D394 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rufy3Q9D394 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rufy3Q9D394 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rufy3Q9D394 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rufy3Q9D394 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rufy3Q9D394 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rufy3Q9D394 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rufy3Q9D394 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rufy3Q9D394 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rufy3Q9D394 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rufy3Q9D394 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Rufy3Q9D394 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rufy3Q9D394 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Rufy3Q9D394 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rufy3Q9D394 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Rufy3Q9D394 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rufy3Q9D394 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rufy3Q9D394 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rufy3Q9D394 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rufy3Q9D394 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rufy3Q9D394 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rufy3Q9D394 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rufy3Q9D394 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rufy3Q9D394 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rufy3Q9D394 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rufy3Q9D394 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rufy3Q9D394 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rufy3Q9D394 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rufy3Q9D394 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rufy3Q9D394 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rufy3Q9D394 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rufy3Q9D394 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rufy3Q9D394 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rufy3Q9D394 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rufy3Q9D394 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rufy3Q9D394 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rufy3Q9D394 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rufy3Q9D394 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Rufy3Q9D394 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rufy3Q9D394 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rufy3Q9D394 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rufy3Q9D394 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rufy3Q9D394 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rufy3Q9D394 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Rufy3Q9D394 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Rufy3Q9D394 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Rufy3Q9D394 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Rufy3Q9D394 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Rufy3Q9D394 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rufy3Q9D394 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rufy3Q9D394 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rufy3Q9D394 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rufy3Q9D394 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rufy3Q9D394 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rufy3Q9D394 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rufy3Q9D394 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rufy3Q9D394 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rufy3Q9D394 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rufy3Q9D394 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rufy3Q9D394 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rufy3Q9D394 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rufy3Q9D394 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rufy3Q9D394 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rufy3Q9D394 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rufy3Q9D394 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms