Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2F1

Pramef12, PRAME family member 12, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef12Q9D2F1 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pramef12Q9D2F1 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pramef12Q9D2F1 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pramef12Q9D2F1 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pramef12Q9D2F1 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Pramef12Q9D2F1 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Pramef12Q9D2F1 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Pramef12Q9D2F1 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
Pramef12Q9D2F1 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Pramef12Q9D2F1 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Pramef12Q9D2F1 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Pramef12Q9D2F1 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pramef12Q9D2F1 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pramef12Q9D2F1 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pramef12Q9D2F1 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pramef12Q9D2F1 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pramef12Q9D2F1 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pramef12Q9D2F1 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pramef12Q9D2F1 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pramef12Q9D2F1 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pramef12Q9D2F1 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pramef12Q9D2F1 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pramef12Q9D2F1 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pramef12Q9D2F1 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pramef12Q9D2F1 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pramef12Q9D2F1 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pramef12Q9D2F1 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pramef12Q9D2F1 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pramef12Q9D2F1 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pramef12Q9D2F1 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pramef12Q9D2F1 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pramef12Q9D2F1 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pramef12Q9D2F1 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pramef12Q9D2F1 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pramef12Q9D2F1 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pramef12Q9D2F1 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pramef12Q9D2F1 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pramef12Q9D2F1 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pramef12Q9D2F1 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pramef12Q9D2F1 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Pramef12Q9D2F1 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pramef12Q9D2F1 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pramef12Q9D2F1 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Pramef12Q9D2F1 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pramef12Q9D2F1 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pramef12Q9D2F1 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pramef12Q9D2F1 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pramef12Q9D2F1 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pramef12Q9D2F1 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pramef12Q9D2F1 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pramef12Q9D2F1 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pramef12Q9D2F1 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pramef12Q9D2F1 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pramef12Q9D2F1 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pramef12Q9D2F1 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pramef12Q9D2F1 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pramef12Q9D2F1 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pramef12Q9D2F1 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pramef12Q9D2F1 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pramef12Q9D2F1 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pramef12Q9D2F1 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pramef12Q9D2F1 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pramef12Q9D2F1 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pramef12Q9D2F1 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pramef12Q9D2F1 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pramef12Q9D2F1 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pramef12Q9D2F1 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pramef12Q9D2F1 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pramef12Q9D2F1 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pramef12Q9D2F1 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Pramef12Q9D2F1 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pramef12Q9D2F1 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pramef12Q9D2F1 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pramef12Q9D2F1 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pramef12Q9D2F1 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pramef12Q9D2F1 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pramef12Q9D2F1 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pramef12Q9D2F1 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pramef12Q9D2F1 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pramef12Q9D2F1 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pramef12Q9D2F1 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pramef12Q9D2F1 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pramef12Q9D2F1 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pramef12Q9D2F1 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pramef12Q9D2F1 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pramef12Q9D2F1 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pramef12Q9D2F1 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pramef12Q9D2F1 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pramef12Q9D2F1 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pramef12Q9D2F1 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pramef12Q9D2F1 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pramef12Q9D2F1 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pramef12Q9D2F1 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pramef12Q9D2F1 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pramef12Q9D2F1 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Pramef12Q9D2F1 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pramef12Q9D2F1 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pramef12Q9D2F1 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pramef12Q9D2F1 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pramef12Q9D2F1 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms