Protein–RNA interactions for Protein: Q9D287

Bcas2, Pre-mRNA-splicing factor SPF27, mousemouse

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bcas2Q9D287 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Bcas2Q9D287 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Bcas2Q9D287 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Bcas2Q9D287 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Bcas2Q9D287 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Bcas2Q9D287 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Bcas2Q9D287 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Bcas2Q9D287 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Bcas2Q9D287 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Bcas2Q9D287 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Bcas2Q9D287 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Bcas2Q9D287 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Bcas2Q9D287 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Bcas2Q9D287 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Bcas2Q9D287 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Bcas2Q9D287 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Bcas2Q9D287 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Bcas2Q9D287 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Bcas2Q9D287 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Bcas2Q9D287 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Bcas2Q9D287 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Bcas2Q9D287 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Bcas2Q9D287 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Bcas2Q9D287 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Bcas2Q9D287 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Bcas2Q9D287 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Bcas2Q9D287 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Bcas2Q9D287 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Bcas2Q9D287 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Bcas2Q9D287 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Bcas2Q9D287 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Bcas2Q9D287 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Bcas2Q9D287 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Bcas2Q9D287 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Bcas2Q9D287 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Bcas2Q9D287 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Bcas2Q9D287 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Bcas2Q9D287 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Bcas2Q9D287 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Bcas2Q9D287 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Bcas2Q9D287 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Bcas2Q9D287 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Bcas2Q9D287 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Bcas2Q9D287 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Bcas2Q9D287 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Bcas2Q9D287 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Bcas2Q9D287 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Bcas2Q9D287 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Bcas2Q9D287 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Bcas2Q9D287 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Bcas2Q9D287 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Bcas2Q9D287 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Bcas2Q9D287 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Bcas2Q9D287 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Bcas2Q9D287 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Bcas2Q9D287 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Bcas2Q9D287 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Bcas2Q9D287 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Bcas2Q9D287 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Bcas2Q9D287 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Bcas2Q9D287 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Bcas2Q9D287 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Bcas2Q9D287 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Bcas2Q9D287 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Bcas2Q9D287 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Bcas2Q9D287 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Bcas2Q9D287 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Bcas2Q9D287 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Bcas2Q9D287 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Bcas2Q9D287 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Bcas2Q9D287 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Bcas2Q9D287 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Bcas2Q9D287 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Bcas2Q9D287 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Bcas2Q9D287 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Bcas2Q9D287 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Bcas2Q9D287 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Bcas2Q9D287 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Bcas2Q9D287 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Bcas2Q9D287 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Bcas2Q9D287 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Bcas2Q9D287 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Bcas2Q9D287 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Bcas2Q9D287 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Bcas2Q9D287 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Bcas2Q9D287 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Bcas2Q9D287 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Bcas2Q9D287 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Bcas2Q9D287 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Bcas2Q9D287 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Bcas2Q9D287 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Bcas2Q9D287 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Bcas2Q9D287 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Bcas2Q9D287 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Bcas2Q9D287 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Bcas2Q9D287 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Bcas2Q9D287 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Bcas2Q9D287 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Bcas2Q9D287 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Bcas2Q9D287 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms