Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1R9

Rpl34, 60S ribosomal protein L34, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl34Q9D1R9 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rpl34Q9D1R9 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rpl34Q9D1R9 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rpl34Q9D1R9 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rpl34Q9D1R9 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rpl34Q9D1R9 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rpl34Q9D1R9 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rpl34Q9D1R9 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rpl34Q9D1R9 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rpl34Q9D1R9 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rpl34Q9D1R9 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rpl34Q9D1R9 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rpl34Q9D1R9 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rpl34Q9D1R9 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rpl34Q9D1R9 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rpl34Q9D1R9 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rpl34Q9D1R9 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rpl34Q9D1R9 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rpl34Q9D1R9 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rpl34Q9D1R9 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rpl34Q9D1R9 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rpl34Q9D1R9 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rpl34Q9D1R9 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rpl34Q9D1R9 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rpl34Q9D1R9 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rpl34Q9D1R9 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rpl34Q9D1R9 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rpl34Q9D1R9 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Rpl34Q9D1R9 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rpl34Q9D1R9 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rpl34Q9D1R9 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rpl34Q9D1R9 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rpl34Q9D1R9 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rpl34Q9D1R9 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rpl34Q9D1R9 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rpl34Q9D1R9 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rpl34Q9D1R9 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rpl34Q9D1R9 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rpl34Q9D1R9 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rpl34Q9D1R9 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rpl34Q9D1R9 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rpl34Q9D1R9 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rpl34Q9D1R9 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Rpl34Q9D1R9 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rpl34Q9D1R9 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rpl34Q9D1R9 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rpl34Q9D1R9 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rpl34Q9D1R9 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rpl34Q9D1R9 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rpl34Q9D1R9 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rpl34Q9D1R9 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rpl34Q9D1R9 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rpl34Q9D1R9 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rpl34Q9D1R9 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rpl34Q9D1R9 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rpl34Q9D1R9 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rpl34Q9D1R9 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rpl34Q9D1R9 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rpl34Q9D1R9 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rpl34Q9D1R9 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rpl34Q9D1R9 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rpl34Q9D1R9 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rpl34Q9D1R9 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Rpl34Q9D1R9 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rpl34Q9D1R9 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rpl34Q9D1R9 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rpl34Q9D1R9 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rpl34Q9D1R9 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rpl34Q9D1R9 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rpl34Q9D1R9 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rpl34Q9D1R9 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rpl34Q9D1R9 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rpl34Q9D1R9 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rpl34Q9D1R9 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rpl34Q9D1R9 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rpl34Q9D1R9 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rpl34Q9D1R9 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rpl34Q9D1R9 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rpl34Q9D1R9 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rpl34Q9D1R9 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Rpl34Q9D1R9 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rpl34Q9D1R9 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Rpl34Q9D1R9 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rpl34Q9D1R9 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rpl34Q9D1R9 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rpl34Q9D1R9 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rpl34Q9D1R9 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rpl34Q9D1R9 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rpl34Q9D1R9 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rpl34Q9D1R9 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rpl34Q9D1R9 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rpl34Q9D1R9 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rpl34Q9D1R9 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rpl34Q9D1R9 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rpl34Q9D1R9 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rpl34Q9D1R9 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rpl34Q9D1R9 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rpl34Q9D1R9 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rpl34Q9D1R9 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rpl34Q9D1R9 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms