Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1H6

Ndufaf4, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex assembly factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufaf4Q9D1H6 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ndufaf4Q9D1H6 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ndufaf4Q9D1H6 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ndufaf4Q9D1H6 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ndufaf4Q9D1H6 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ndufaf4Q9D1H6 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ndufaf4Q9D1H6 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ndufaf4Q9D1H6 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ndufaf4Q9D1H6 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ndufaf4Q9D1H6 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ndufaf4Q9D1H6 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ndufaf4Q9D1H6 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ndufaf4Q9D1H6 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ndufaf4Q9D1H6 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ndufaf4Q9D1H6 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ndufaf4Q9D1H6 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ndufaf4Q9D1H6 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ndufaf4Q9D1H6 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ndufaf4Q9D1H6 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ndufaf4Q9D1H6 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ndufaf4Q9D1H6 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ndufaf4Q9D1H6 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ndufaf4Q9D1H6 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ndufaf4Q9D1H6 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ndufaf4Q9D1H6 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ndufaf4Q9D1H6 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ndufaf4Q9D1H6 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ndufaf4Q9D1H6 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ndufaf4Q9D1H6 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ndufaf4Q9D1H6 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ndufaf4Q9D1H6 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ndufaf4Q9D1H6 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ndufaf4Q9D1H6 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ndufaf4Q9D1H6 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ndufaf4Q9D1H6 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ndufaf4Q9D1H6 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ndufaf4Q9D1H6 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ndufaf4Q9D1H6 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ndufaf4Q9D1H6 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ndufaf4Q9D1H6 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ndufaf4Q9D1H6 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ndufaf4Q9D1H6 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ndufaf4Q9D1H6 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ndufaf4Q9D1H6 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ndufaf4Q9D1H6 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ndufaf4Q9D1H6 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ndufaf4Q9D1H6 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ndufaf4Q9D1H6 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ndufaf4Q9D1H6 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ndufaf4Q9D1H6 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ndufaf4Q9D1H6 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ndufaf4Q9D1H6 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ndufaf4Q9D1H6 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ndufaf4Q9D1H6 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ndufaf4Q9D1H6 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ndufaf4Q9D1H6 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ndufaf4Q9D1H6 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ndufaf4Q9D1H6 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ndufaf4Q9D1H6 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ndufaf4Q9D1H6 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ndufaf4Q9D1H6 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ndufaf4Q9D1H6 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ndufaf4Q9D1H6 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ndufaf4Q9D1H6 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ndufaf4Q9D1H6 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ndufaf4Q9D1H6 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ndufaf4Q9D1H6 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ndufaf4Q9D1H6 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ndufaf4Q9D1H6 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ndufaf4Q9D1H6 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ndufaf4Q9D1H6 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ndufaf4Q9D1H6 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ndufaf4Q9D1H6 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ndufaf4Q9D1H6 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ndufaf4Q9D1H6 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ndufaf4Q9D1H6 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ndufaf4Q9D1H6 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ndufaf4Q9D1H6 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ndufaf4Q9D1H6 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ndufaf4Q9D1H6 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ndufaf4Q9D1H6 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ndufaf4Q9D1H6 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ndufaf4Q9D1H6 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ndufaf4Q9D1H6 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ndufaf4Q9D1H6 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ndufaf4Q9D1H6 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ndufaf4Q9D1H6 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ndufaf4Q9D1H6 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ndufaf4Q9D1H6 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ndufaf4Q9D1H6 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ndufaf4Q9D1H6 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ndufaf4Q9D1H6 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ndufaf4Q9D1H6 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ndufaf4Q9D1H6 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ndufaf4Q9D1H6 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ndufaf4Q9D1H6 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ndufaf4Q9D1H6 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ndufaf4Q9D1H6 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ndufaf4Q9D1H6 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ndufaf4Q9D1H6 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms