Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1F3

Uncharacterized protein CXorf40 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 157 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D1F3 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Q9D1F3 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Q9D1F3 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q9D1F3 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q9D1F3 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q9D1F3 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q9D1F3 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q9D1F3 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q9D1F3 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q9D1F3 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Q9D1F3 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q9D1F3 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q9D1F3 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q9D1F3 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q9D1F3 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q9D1F3 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Q9D1F3 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q9D1F3 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Q9D1F3 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q9D1F3 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q9D1F3 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q9D1F3 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q9D1F3 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q9D1F3 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q9D1F3 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Q9D1F3 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q9D1F3 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q9D1F3 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Q9D1F3 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q9D1F3 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q9D1F3 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Q9D1F3 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q9D1F3 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q9D1F3 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q9D1F3 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q9D1F3 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q9D1F3 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q9D1F3 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q9D1F3 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q9D1F3 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q9D1F3 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q9D1F3 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q9D1F3 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q9D1F3 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q9D1F3 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q9D1F3 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Q9D1F3 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q9D1F3 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Q9D1F3 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q9D1F3 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q9D1F3 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q9D1F3 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q9D1F3 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q9D1F3 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q9D1F3 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q9D1F3 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q9D1F3 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q9D1F3 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q9D1F3 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q9D1F3 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q9D1F3 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q9D1F3 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Q9D1F3 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q9D1F3 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q9D1F3 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q9D1F3 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q9D1F3 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q9D1F3 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q9D1F3 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q9D1F3 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q9D1F3 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Q9D1F3 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q9D1F3 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Q9D1F3 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q9D1F3 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q9D1F3 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q9D1F3 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q9D1F3 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q9D1F3 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q9D1F3 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q9D1F3 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q9D1F3 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q9D1F3 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q9D1F3 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q9D1F3 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q9D1F3 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q9D1F3 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q9D1F3 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q9D1F3 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q9D1F3 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q9D1F3 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q9D1F3 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q9D1F3 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q9D1F3 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q9D1F3 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Q9D1F3 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Q9D1F3 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q9D1F3 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q9D1F3 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q9D1F3 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms