Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1E5

Lmbr1l, Protein LMBR1L, mousemouse

Predictions only

Length 489 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmbr1lQ9D1E5 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lmbr1lQ9D1E5 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lmbr1lQ9D1E5 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lmbr1lQ9D1E5 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lmbr1lQ9D1E5 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lmbr1lQ9D1E5 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lmbr1lQ9D1E5 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lmbr1lQ9D1E5 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lmbr1lQ9D1E5 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Lmbr1lQ9D1E5 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lmbr1lQ9D1E5 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lmbr1lQ9D1E5 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lmbr1lQ9D1E5 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lmbr1lQ9D1E5 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lmbr1lQ9D1E5 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lmbr1lQ9D1E5 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Lmbr1lQ9D1E5 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Lmbr1lQ9D1E5 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Lmbr1lQ9D1E5 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Lmbr1lQ9D1E5 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Lmbr1lQ9D1E5 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Lmbr1lQ9D1E5 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Lmbr1lQ9D1E5 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Lmbr1lQ9D1E5 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Lmbr1lQ9D1E5 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Lmbr1lQ9D1E5 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Lmbr1lQ9D1E5 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Lmbr1lQ9D1E5 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Lmbr1lQ9D1E5 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Lmbr1lQ9D1E5 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Lmbr1lQ9D1E5 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Lmbr1lQ9D1E5 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Lmbr1lQ9D1E5 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Lmbr1lQ9D1E5 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Lmbr1lQ9D1E5 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Lmbr1lQ9D1E5 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Lmbr1lQ9D1E5 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Lmbr1lQ9D1E5 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Lmbr1lQ9D1E5 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Lmbr1lQ9D1E5 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Lmbr1lQ9D1E5 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Lmbr1lQ9D1E5 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Lmbr1lQ9D1E5 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Lmbr1lQ9D1E5 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Lmbr1lQ9D1E5 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Lmbr1lQ9D1E5 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Lmbr1lQ9D1E5 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Lmbr1lQ9D1E5 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Lmbr1lQ9D1E5 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Lmbr1lQ9D1E5 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Lmbr1lQ9D1E5 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Lmbr1lQ9D1E5 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Lmbr1lQ9D1E5 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Lmbr1lQ9D1E5 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Lmbr1lQ9D1E5 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Lmbr1lQ9D1E5 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Lmbr1lQ9D1E5 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Lmbr1lQ9D1E5 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Lmbr1lQ9D1E5 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Lmbr1lQ9D1E5 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Lmbr1lQ9D1E5 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Lmbr1lQ9D1E5 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Lmbr1lQ9D1E5 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Lmbr1lQ9D1E5 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Lmbr1lQ9D1E5 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Lmbr1lQ9D1E5 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Lmbr1lQ9D1E5 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Lmbr1lQ9D1E5 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Lmbr1lQ9D1E5 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Lmbr1lQ9D1E5 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Lmbr1lQ9D1E5 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Lmbr1lQ9D1E5 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Lmbr1lQ9D1E5 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Lmbr1lQ9D1E5 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Lmbr1lQ9D1E5 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Lmbr1lQ9D1E5 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Lmbr1lQ9D1E5 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Lmbr1lQ9D1E5 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Lmbr1lQ9D1E5 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Lmbr1lQ9D1E5 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Lmbr1lQ9D1E5 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Lmbr1lQ9D1E5 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Lmbr1lQ9D1E5 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Lmbr1lQ9D1E5 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Lmbr1lQ9D1E5 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Lmbr1lQ9D1E5 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Lmbr1lQ9D1E5 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Lmbr1lQ9D1E5 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Lmbr1lQ9D1E5 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Lmbr1lQ9D1E5 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Lmbr1lQ9D1E5 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Lmbr1lQ9D1E5 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Lmbr1lQ9D1E5 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Lmbr1lQ9D1E5 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Lmbr1lQ9D1E5 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Lmbr1lQ9D1E5 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Lmbr1lQ9D1E5 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Lmbr1lQ9D1E5 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Lmbr1lQ9D1E5 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Lmbr1lQ9D1E5 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms