Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1D1

Tspan11, Tetraspanin-11, mousemouse

Predictions only

Length 253 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan11Q9D1D1 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tspan11Q9D1D1 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tspan11Q9D1D1 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tspan11Q9D1D1 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tspan11Q9D1D1 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tspan11Q9D1D1 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tspan11Q9D1D1 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tspan11Q9D1D1 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tspan11Q9D1D1 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tspan11Q9D1D1 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tspan11Q9D1D1 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tspan11Q9D1D1 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tspan11Q9D1D1 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tspan11Q9D1D1 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Tspan11Q9D1D1 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tspan11Q9D1D1 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Tspan11Q9D1D1 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tspan11Q9D1D1 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tspan11Q9D1D1 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tspan11Q9D1D1 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tspan11Q9D1D1 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tspan11Q9D1D1 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tspan11Q9D1D1 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tspan11Q9D1D1 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tspan11Q9D1D1 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tspan11Q9D1D1 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tspan11Q9D1D1 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tspan11Q9D1D1 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tspan11Q9D1D1 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Tspan11Q9D1D1 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tspan11Q9D1D1 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tspan11Q9D1D1 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tspan11Q9D1D1 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tspan11Q9D1D1 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tspan11Q9D1D1 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tspan11Q9D1D1 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tspan11Q9D1D1 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Tspan11Q9D1D1 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tspan11Q9D1D1 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tspan11Q9D1D1 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tspan11Q9D1D1 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tspan11Q9D1D1 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tspan11Q9D1D1 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tspan11Q9D1D1 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tspan11Q9D1D1 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tspan11Q9D1D1 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Tspan11Q9D1D1 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tspan11Q9D1D1 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tspan11Q9D1D1 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tspan11Q9D1D1 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tspan11Q9D1D1 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tspan11Q9D1D1 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tspan11Q9D1D1 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tspan11Q9D1D1 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tspan11Q9D1D1 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tspan11Q9D1D1 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tspan11Q9D1D1 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tspan11Q9D1D1 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tspan11Q9D1D1 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tspan11Q9D1D1 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tspan11Q9D1D1 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tspan11Q9D1D1 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tspan11Q9D1D1 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tspan11Q9D1D1 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Tspan11Q9D1D1 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tspan11Q9D1D1 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tspan11Q9D1D1 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tspan11Q9D1D1 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tspan11Q9D1D1 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tspan11Q9D1D1 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tspan11Q9D1D1 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tspan11Q9D1D1 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tspan11Q9D1D1 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tspan11Q9D1D1 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tspan11Q9D1D1 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tspan11Q9D1D1 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tspan11Q9D1D1 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tspan11Q9D1D1 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tspan11Q9D1D1 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tspan11Q9D1D1 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tspan11Q9D1D1 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tspan11Q9D1D1 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tspan11Q9D1D1 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tspan11Q9D1D1 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tspan11Q9D1D1 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tspan11Q9D1D1 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tspan11Q9D1D1 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tspan11Q9D1D1 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tspan11Q9D1D1 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tspan11Q9D1D1 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tspan11Q9D1D1 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tspan11Q9D1D1 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tspan11Q9D1D1 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tspan11Q9D1D1 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tspan11Q9D1D1 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tspan11Q9D1D1 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tspan11Q9D1D1 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tspan11Q9D1D1 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tspan11Q9D1D1 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tspan11Q9D1D1 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.7 ms