Protein–RNA interactions for Protein: Q9D176

Susd3, Sushi domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Susd3Q9D176 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Susd3Q9D176 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Susd3Q9D176 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Susd3Q9D176 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Susd3Q9D176 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Susd3Q9D176 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Susd3Q9D176 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Susd3Q9D176 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Susd3Q9D176 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Susd3Q9D176 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Susd3Q9D176 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Susd3Q9D176 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Susd3Q9D176 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Susd3Q9D176 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Susd3Q9D176 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Susd3Q9D176 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Susd3Q9D176 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Susd3Q9D176 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Susd3Q9D176 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Susd3Q9D176 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Susd3Q9D176 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Susd3Q9D176 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Susd3Q9D176 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Susd3Q9D176 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Susd3Q9D176 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Susd3Q9D176 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Susd3Q9D176 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Susd3Q9D176 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Susd3Q9D176 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Susd3Q9D176 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Susd3Q9D176 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Susd3Q9D176 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Susd3Q9D176 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Susd3Q9D176 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Susd3Q9D176 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Susd3Q9D176 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Susd3Q9D176 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Susd3Q9D176 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Susd3Q9D176 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Susd3Q9D176 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Susd3Q9D176 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Susd3Q9D176 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Susd3Q9D176 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Susd3Q9D176 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Susd3Q9D176 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Susd3Q9D176 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Susd3Q9D176 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Susd3Q9D176 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Susd3Q9D176 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Susd3Q9D176 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Susd3Q9D176 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Susd3Q9D176 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Susd3Q9D176 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Susd3Q9D176 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Susd3Q9D176 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Susd3Q9D176 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Susd3Q9D176 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Susd3Q9D176 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Susd3Q9D176 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Susd3Q9D176 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Susd3Q9D176 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Susd3Q9D176 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Susd3Q9D176 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Susd3Q9D176 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Susd3Q9D176 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Susd3Q9D176 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Susd3Q9D176 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Susd3Q9D176 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Susd3Q9D176 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Susd3Q9D176 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Susd3Q9D176 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Susd3Q9D176 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Susd3Q9D176 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Susd3Q9D176 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Susd3Q9D176 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Susd3Q9D176 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Susd3Q9D176 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Susd3Q9D176 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Susd3Q9D176 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Susd3Q9D176 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Susd3Q9D176 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Susd3Q9D176 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Susd3Q9D176 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Susd3Q9D176 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Susd3Q9D176 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Susd3Q9D176 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Susd3Q9D176 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Susd3Q9D176 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Susd3Q9D176 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Susd3Q9D176 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Susd3Q9D176 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Susd3Q9D176 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Susd3Q9D176 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Susd3Q9D176 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Susd3Q9D176 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Susd3Q9D176 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Susd3Q9D176 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Susd3Q9D176 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Susd3Q9D176 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Susd3Q9D176 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms