Protein–RNA interactions for Protein: Q9D162

Ccdc167, Coiled-coil domain-containing protein 167, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc167Q9D162 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Ccdc167Q9D162 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ccdc167Q9D162 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ccdc167Q9D162 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ccdc167Q9D162 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ccdc167Q9D162 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ccdc167Q9D162 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ccdc167Q9D162 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ccdc167Q9D162 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ccdc167Q9D162 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Ccdc167Q9D162 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ccdc167Q9D162 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ccdc167Q9D162 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ccdc167Q9D162 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ccdc167Q9D162 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ccdc167Q9D162 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ccdc167Q9D162 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ccdc167Q9D162 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ccdc167Q9D162 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ccdc167Q9D162 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ccdc167Q9D162 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ccdc167Q9D162 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ccdc167Q9D162 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ccdc167Q9D162 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ccdc167Q9D162 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ccdc167Q9D162 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ccdc167Q9D162 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ccdc167Q9D162 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ccdc167Q9D162 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ccdc167Q9D162 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ccdc167Q9D162 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ccdc167Q9D162 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ccdc167Q9D162 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ccdc167Q9D162 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ccdc167Q9D162 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ccdc167Q9D162 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Ccdc167Q9D162 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ccdc167Q9D162 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ccdc167Q9D162 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ccdc167Q9D162 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ccdc167Q9D162 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ccdc167Q9D162 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ccdc167Q9D162 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ccdc167Q9D162 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ccdc167Q9D162 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ccdc167Q9D162 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ccdc167Q9D162 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ccdc167Q9D162 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ccdc167Q9D162 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ccdc167Q9D162 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ccdc167Q9D162 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ccdc167Q9D162 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ccdc167Q9D162 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ccdc167Q9D162 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ccdc167Q9D162 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ccdc167Q9D162 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ccdc167Q9D162 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ccdc167Q9D162 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ccdc167Q9D162 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ccdc167Q9D162 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ccdc167Q9D162 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ccdc167Q9D162 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ccdc167Q9D162 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ccdc167Q9D162 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Ccdc167Q9D162 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ccdc167Q9D162 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ccdc167Q9D162 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ccdc167Q9D162 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Ccdc167Q9D162 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ccdc167Q9D162 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ccdc167Q9D162 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ccdc167Q9D162 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ccdc167Q9D162 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ccdc167Q9D162 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ccdc167Q9D162 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ccdc167Q9D162 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ccdc167Q9D162 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ccdc167Q9D162 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ccdc167Q9D162 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ccdc167Q9D162 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ccdc167Q9D162 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ccdc167Q9D162 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ccdc167Q9D162 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ccdc167Q9D162 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ccdc167Q9D162 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ccdc167Q9D162 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ccdc167Q9D162 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ccdc167Q9D162 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ccdc167Q9D162 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ccdc167Q9D162 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Ccdc167Q9D162 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ccdc167Q9D162 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ccdc167Q9D162 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ccdc167Q9D162 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ccdc167Q9D162 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Ccdc167Q9D162 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.15
Ccdc167Q9D162 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.15
Ccdc167Q9D162 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ccdc167Q9D162 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ccdc167Q9D162 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms