Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0R8

Lsm12, Protein LSM12 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lsm12Q9D0R8 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lsm12Q9D0R8 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lsm12Q9D0R8 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lsm12Q9D0R8 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lsm12Q9D0R8 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Lsm12Q9D0R8 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lsm12Q9D0R8 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lsm12Q9D0R8 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lsm12Q9D0R8 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lsm12Q9D0R8 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lsm12Q9D0R8 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lsm12Q9D0R8 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lsm12Q9D0R8 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lsm12Q9D0R8 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lsm12Q9D0R8 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lsm12Q9D0R8 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lsm12Q9D0R8 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Lsm12Q9D0R8 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Lsm12Q9D0R8 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lsm12Q9D0R8 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lsm12Q9D0R8 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lsm12Q9D0R8 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lsm12Q9D0R8 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lsm12Q9D0R8 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lsm12Q9D0R8 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lsm12Q9D0R8 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lsm12Q9D0R8 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lsm12Q9D0R8 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Lsm12Q9D0R8 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lsm12Q9D0R8 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lsm12Q9D0R8 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Lsm12Q9D0R8 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lsm12Q9D0R8 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lsm12Q9D0R8 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lsm12Q9D0R8 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lsm12Q9D0R8 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lsm12Q9D0R8 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lsm12Q9D0R8 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lsm12Q9D0R8 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lsm12Q9D0R8 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Lsm12Q9D0R8 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lsm12Q9D0R8 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lsm12Q9D0R8 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lsm12Q9D0R8 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lsm12Q9D0R8 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lsm12Q9D0R8 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lsm12Q9D0R8 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lsm12Q9D0R8 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lsm12Q9D0R8 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lsm12Q9D0R8 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lsm12Q9D0R8 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lsm12Q9D0R8 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lsm12Q9D0R8 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lsm12Q9D0R8 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lsm12Q9D0R8 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lsm12Q9D0R8 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lsm12Q9D0R8 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lsm12Q9D0R8 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lsm12Q9D0R8 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lsm12Q9D0R8 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lsm12Q9D0R8 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Lsm12Q9D0R8 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lsm12Q9D0R8 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lsm12Q9D0R8 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lsm12Q9D0R8 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lsm12Q9D0R8 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lsm12Q9D0R8 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lsm12Q9D0R8 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lsm12Q9D0R8 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lsm12Q9D0R8 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Lsm12Q9D0R8 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lsm12Q9D0R8 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lsm12Q9D0R8 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lsm12Q9D0R8 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lsm12Q9D0R8 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lsm12Q9D0R8 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lsm12Q9D0R8 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lsm12Q9D0R8 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lsm12Q9D0R8 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lsm12Q9D0R8 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Lsm12Q9D0R8 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Lsm12Q9D0R8 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lsm12Q9D0R8 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lsm12Q9D0R8 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lsm12Q9D0R8 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lsm12Q9D0R8 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lsm12Q9D0R8 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lsm12Q9D0R8 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lsm12Q9D0R8 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Lsm12Q9D0R8 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lsm12Q9D0R8 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Lsm12Q9D0R8 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lsm12Q9D0R8 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lsm12Q9D0R8 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lsm12Q9D0R8 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lsm12Q9D0R8 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lsm12Q9D0R8 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lsm12Q9D0R8 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Lsm12Q9D0R8 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lsm12Q9D0R8 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms