Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0B0

Srsf9, Serine/arginine-rich splicing factor 9, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 222 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf9Q9D0B0 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Srsf9Q9D0B0 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Srsf9Q9D0B0 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Srsf9Q9D0B0 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Srsf9Q9D0B0 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Srsf9Q9D0B0 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Srsf9Q9D0B0 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Srsf9Q9D0B0 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Srsf9Q9D0B0 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Srsf9Q9D0B0 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Srsf9Q9D0B0 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Srsf9Q9D0B0 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Srsf9Q9D0B0 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Srsf9Q9D0B0 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Srsf9Q9D0B0 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Srsf9Q9D0B0 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Srsf9Q9D0B0 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Srsf9Q9D0B0 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Srsf9Q9D0B0 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Srsf9Q9D0B0 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Srsf9Q9D0B0 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Srsf9Q9D0B0 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Srsf9Q9D0B0 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Srsf9Q9D0B0 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Srsf9Q9D0B0 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Srsf9Q9D0B0 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Srsf9Q9D0B0 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Srsf9Q9D0B0 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Srsf9Q9D0B0 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Srsf9Q9D0B0 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Srsf9Q9D0B0 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Srsf9Q9D0B0 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Srsf9Q9D0B0 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Srsf9Q9D0B0 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Srsf9Q9D0B0 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Srsf9Q9D0B0 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Srsf9Q9D0B0 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Srsf9Q9D0B0 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Srsf9Q9D0B0 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Srsf9Q9D0B0 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Srsf9Q9D0B0 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Srsf9Q9D0B0 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Srsf9Q9D0B0 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Srsf9Q9D0B0 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Srsf9Q9D0B0 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Srsf9Q9D0B0 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Srsf9Q9D0B0 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Srsf9Q9D0B0 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Srsf9Q9D0B0 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Srsf9Q9D0B0 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Srsf9Q9D0B0 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Srsf9Q9D0B0 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Srsf9Q9D0B0 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Srsf9Q9D0B0 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Srsf9Q9D0B0 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Srsf9Q9D0B0 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Srsf9Q9D0B0 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Srsf9Q9D0B0 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Srsf9Q9D0B0 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Srsf9Q9D0B0 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Srsf9Q9D0B0 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Srsf9Q9D0B0 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Srsf9Q9D0B0 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Srsf9Q9D0B0 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Srsf9Q9D0B0 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Srsf9Q9D0B0 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Srsf9Q9D0B0 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Srsf9Q9D0B0 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Srsf9Q9D0B0 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Srsf9Q9D0B0 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Srsf9Q9D0B0 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Srsf9Q9D0B0 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Srsf9Q9D0B0 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Srsf9Q9D0B0 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Srsf9Q9D0B0 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Srsf9Q9D0B0 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Srsf9Q9D0B0 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Srsf9Q9D0B0 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Srsf9Q9D0B0 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Srsf9Q9D0B0 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Srsf9Q9D0B0 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Srsf9Q9D0B0 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Srsf9Q9D0B0 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Srsf9Q9D0B0 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Srsf9Q9D0B0 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Srsf9Q9D0B0 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Srsf9Q9D0B0 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Srsf9Q9D0B0 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Srsf9Q9D0B0 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Srsf9Q9D0B0 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Srsf9Q9D0B0 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Srsf9Q9D0B0 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Srsf9Q9D0B0 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Srsf9Q9D0B0 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Srsf9Q9D0B0 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Srsf9Q9D0B0 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Srsf9Q9D0B0 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Srsf9Q9D0B0 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Srsf9Q9D0B0 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Srsf9Q9D0B0 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms