Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc47Q9D024 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc47Q9D024 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc47Q9D024 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc47Q9D024 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc47Q9D024 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc47Q9D024 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc47Q9D024 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc47Q9D024 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc47Q9D024 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc47Q9D024 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc47Q9D024 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc47Q9D024 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc47Q9D024 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc47Q9D024 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc47Q9D024 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc47Q9D024 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc47Q9D024 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc47Q9D024 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc47Q9D024 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc47Q9D024 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc47Q9D024 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc47Q9D024 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc47Q9D024 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc47Q9D024 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc47Q9D024 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc47Q9D024 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc47Q9D024 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc47Q9D024 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc47Q9D024 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc47Q9D024 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc47Q9D024 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc47Q9D024 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc47Q9D024 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc47Q9D024 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc47Q9D024 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc47Q9D024 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc47Q9D024 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc47Q9D024 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc47Q9D024 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc47Q9D024 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc47Q9D024 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc47Q9D024 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc47Q9D024 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc47Q9D024 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc47Q9D024 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc47Q9D024 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc47Q9D024 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc47Q9D024 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc47Q9D024 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc47Q9D024 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc47Q9D024 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc47Q9D024 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc47Q9D024 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc47Q9D024 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc47Q9D024 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc47Q9D024 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc47Q9D024 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc47Q9D024 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc47Q9D024 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc47Q9D024 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc47Q9D024 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc47Q9D024 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc47Q9D024 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc47Q9D024 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc47Q9D024 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc47Q9D024 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc47Q9D024 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc47Q9D024 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc47Q9D024 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc47Q9D024 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc47Q9D024 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc47Q9D024 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc47Q9D024 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc47Q9D024 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc47Q9D024 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc47Q9D024 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc47Q9D024 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc47Q9D024 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc47Q9D024 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc47Q9D024 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc47Q9D024 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc47Q9D024 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc47Q9D024 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc47Q9D024 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc47Q9D024 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ccdc47Q9D024 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ccdc47Q9D024 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ccdc47Q9D024 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ccdc47Q9D024 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ccdc47Q9D024 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc47Q9D024 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc47Q9D024 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc47Q9D024 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc47Q9D024 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc47Q9D024 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc47Q9D024 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc47Q9D024 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc47Q9D024 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc47Q9D024 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
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