Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZX0

Elp3, Elongator complex protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 547 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Elp3Q9CZX0 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Elp3Q9CZX0 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Elp3Q9CZX0 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Elp3Q9CZX0 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Elp3Q9CZX0 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Elp3Q9CZX0 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Elp3Q9CZX0 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Elp3Q9CZX0 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Elp3Q9CZX0 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Elp3Q9CZX0 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Elp3Q9CZX0 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Elp3Q9CZX0 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Elp3Q9CZX0 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Elp3Q9CZX0 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Elp3Q9CZX0 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Elp3Q9CZX0 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Elp3Q9CZX0 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Elp3Q9CZX0 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Elp3Q9CZX0 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Elp3Q9CZX0 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Elp3Q9CZX0 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Elp3Q9CZX0 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Elp3Q9CZX0 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Elp3Q9CZX0 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Elp3Q9CZX0 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Elp3Q9CZX0 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Elp3Q9CZX0 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Elp3Q9CZX0 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Elp3Q9CZX0 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Elp3Q9CZX0 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Elp3Q9CZX0 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Elp3Q9CZX0 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Elp3Q9CZX0 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Elp3Q9CZX0 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Elp3Q9CZX0 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Elp3Q9CZX0 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Elp3Q9CZX0 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Elp3Q9CZX0 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Elp3Q9CZX0 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Elp3Q9CZX0 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Elp3Q9CZX0 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Elp3Q9CZX0 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Elp3Q9CZX0 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Elp3Q9CZX0 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Elp3Q9CZX0 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Elp3Q9CZX0 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Elp3Q9CZX0 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Elp3Q9CZX0 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Elp3Q9CZX0 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Elp3Q9CZX0 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Elp3Q9CZX0 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Elp3Q9CZX0 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Elp3Q9CZX0 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Elp3Q9CZX0 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Elp3Q9CZX0 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Elp3Q9CZX0 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Elp3Q9CZX0 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Elp3Q9CZX0 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Elp3Q9CZX0 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Elp3Q9CZX0 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Elp3Q9CZX0 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Elp3Q9CZX0 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Elp3Q9CZX0 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Elp3Q9CZX0 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Elp3Q9CZX0 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Elp3Q9CZX0 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Elp3Q9CZX0 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Elp3Q9CZX0 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Elp3Q9CZX0 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Elp3Q9CZX0 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Elp3Q9CZX0 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Elp3Q9CZX0 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Elp3Q9CZX0 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Elp3Q9CZX0 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Elp3Q9CZX0 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Elp3Q9CZX0 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Elp3Q9CZX0 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Elp3Q9CZX0 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Elp3Q9CZX0 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Elp3Q9CZX0 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Elp3Q9CZX0 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Elp3Q9CZX0 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Elp3Q9CZX0 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Elp3Q9CZX0 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Elp3Q9CZX0 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Elp3Q9CZX0 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Elp3Q9CZX0 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Elp3Q9CZX0 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Elp3Q9CZX0 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Elp3Q9CZX0 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Elp3Q9CZX0 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Elp3Q9CZX0 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Elp3Q9CZX0 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Elp3Q9CZX0 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Elp3Q9CZX0 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Elp3Q9CZX0 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Elp3Q9CZX0 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Elp3Q9CZX0 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Elp3Q9CZX0 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Elp3Q9CZX0 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms