Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZN7

Shmt2, Serine hydroxymethyltransferase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shmt2Q9CZN7 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Shmt2Q9CZN7 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Shmt2Q9CZN7 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Shmt2Q9CZN7 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Shmt2Q9CZN7 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Shmt2Q9CZN7 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Shmt2Q9CZN7 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Shmt2Q9CZN7 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Shmt2Q9CZN7 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Shmt2Q9CZN7 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Shmt2Q9CZN7 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Shmt2Q9CZN7 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Shmt2Q9CZN7 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Shmt2Q9CZN7 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Shmt2Q9CZN7 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Shmt2Q9CZN7 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Shmt2Q9CZN7 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Shmt2Q9CZN7 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Shmt2Q9CZN7 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Shmt2Q9CZN7 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Shmt2Q9CZN7 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Shmt2Q9CZN7 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Shmt2Q9CZN7 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Shmt2Q9CZN7 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Shmt2Q9CZN7 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Shmt2Q9CZN7 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Shmt2Q9CZN7 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Shmt2Q9CZN7 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Shmt2Q9CZN7 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Shmt2Q9CZN7 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Shmt2Q9CZN7 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Shmt2Q9CZN7 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Shmt2Q9CZN7 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Shmt2Q9CZN7 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Shmt2Q9CZN7 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Shmt2Q9CZN7 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Shmt2Q9CZN7 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Shmt2Q9CZN7 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Shmt2Q9CZN7 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Shmt2Q9CZN7 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Shmt2Q9CZN7 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Shmt2Q9CZN7 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Shmt2Q9CZN7 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Shmt2Q9CZN7 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Shmt2Q9CZN7 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Shmt2Q9CZN7 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Shmt2Q9CZN7 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Shmt2Q9CZN7 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Shmt2Q9CZN7 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Shmt2Q9CZN7 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Shmt2Q9CZN7 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Shmt2Q9CZN7 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Shmt2Q9CZN7 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Shmt2Q9CZN7 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Shmt2Q9CZN7 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Shmt2Q9CZN7 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Shmt2Q9CZN7 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Shmt2Q9CZN7 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Shmt2Q9CZN7 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Shmt2Q9CZN7 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Shmt2Q9CZN7 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Shmt2Q9CZN7 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Shmt2Q9CZN7 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Shmt2Q9CZN7 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Shmt2Q9CZN7 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Shmt2Q9CZN7 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Shmt2Q9CZN7 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Shmt2Q9CZN7 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Shmt2Q9CZN7 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Shmt2Q9CZN7 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Shmt2Q9CZN7 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Shmt2Q9CZN7 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Shmt2Q9CZN7 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Shmt2Q9CZN7 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Shmt2Q9CZN7 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Shmt2Q9CZN7 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Shmt2Q9CZN7 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Shmt2Q9CZN7 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Shmt2Q9CZN7 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Shmt2Q9CZN7 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Shmt2Q9CZN7 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Shmt2Q9CZN7 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Shmt2Q9CZN7 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Shmt2Q9CZN7 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Shmt2Q9CZN7 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Shmt2Q9CZN7 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Shmt2Q9CZN7 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Shmt2Q9CZN7 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Shmt2Q9CZN7 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Shmt2Q9CZN7 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Shmt2Q9CZN7 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Shmt2Q9CZN7 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Shmt2Q9CZN7 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Shmt2Q9CZN7 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Shmt2Q9CZN7 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Shmt2Q9CZN7 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Shmt2Q9CZN7 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Shmt2Q9CZN7 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Shmt2Q9CZN7 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Shmt2Q9CZN7 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms