Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZJ6

Mis18a, Protein Mis18-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mis18aQ9CZJ6 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Mis18aQ9CZJ6 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Mis18aQ9CZJ6 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Mis18aQ9CZJ6 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Mis18aQ9CZJ6 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Mis18aQ9CZJ6 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Mis18aQ9CZJ6 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Mis18aQ9CZJ6 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Mis18aQ9CZJ6 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Mis18aQ9CZJ6 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Mis18aQ9CZJ6 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Mis18aQ9CZJ6 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Mis18aQ9CZJ6 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Mis18aQ9CZJ6 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Mis18aQ9CZJ6 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Mis18aQ9CZJ6 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Mis18aQ9CZJ6 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Mis18aQ9CZJ6 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Mis18aQ9CZJ6 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Mis18aQ9CZJ6 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Mis18aQ9CZJ6 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Mis18aQ9CZJ6 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Mis18aQ9CZJ6 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Mis18aQ9CZJ6 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Mis18aQ9CZJ6 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Mis18aQ9CZJ6 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Mis18aQ9CZJ6 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Mis18aQ9CZJ6 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Mis18aQ9CZJ6 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Mis18aQ9CZJ6 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Mis18aQ9CZJ6 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Mis18aQ9CZJ6 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Mis18aQ9CZJ6 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Mis18aQ9CZJ6 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Mis18aQ9CZJ6 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Mis18aQ9CZJ6 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Mis18aQ9CZJ6 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Mis18aQ9CZJ6 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Mis18aQ9CZJ6 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Mis18aQ9CZJ6 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Mis18aQ9CZJ6 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Mis18aQ9CZJ6 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Mis18aQ9CZJ6 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Mis18aQ9CZJ6 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Mis18aQ9CZJ6 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Mis18aQ9CZJ6 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Mis18aQ9CZJ6 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Mis18aQ9CZJ6 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Mis18aQ9CZJ6 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Mis18aQ9CZJ6 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Mis18aQ9CZJ6 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Mis18aQ9CZJ6 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Mis18aQ9CZJ6 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Mis18aQ9CZJ6 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Mis18aQ9CZJ6 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Mis18aQ9CZJ6 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Mis18aQ9CZJ6 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Mis18aQ9CZJ6 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Mis18aQ9CZJ6 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Mis18aQ9CZJ6 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Mis18aQ9CZJ6 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Mis18aQ9CZJ6 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Mis18aQ9CZJ6 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Mis18aQ9CZJ6 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Mis18aQ9CZJ6 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Mis18aQ9CZJ6 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Mis18aQ9CZJ6 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Mis18aQ9CZJ6 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Mis18aQ9CZJ6 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Mis18aQ9CZJ6 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Mis18aQ9CZJ6 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Mis18aQ9CZJ6 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Mis18aQ9CZJ6 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Mis18aQ9CZJ6 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Mis18aQ9CZJ6 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Mis18aQ9CZJ6 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Mis18aQ9CZJ6 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Mis18aQ9CZJ6 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Mis18aQ9CZJ6 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Mis18aQ9CZJ6 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Mis18aQ9CZJ6 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Mis18aQ9CZJ6 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Mis18aQ9CZJ6 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Mis18aQ9CZJ6 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Mis18aQ9CZJ6 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Mis18aQ9CZJ6 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Mis18aQ9CZJ6 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Mis18aQ9CZJ6 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Mis18aQ9CZJ6 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Mis18aQ9CZJ6 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Mis18aQ9CZJ6 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Mis18aQ9CZJ6 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Mis18aQ9CZJ6 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Mis18aQ9CZJ6 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mis18aQ9CZJ6 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mis18aQ9CZJ6 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mis18aQ9CZJ6 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mis18aQ9CZJ6 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mis18aQ9CZJ6 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mis18aQ9CZJ6 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms