Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZ04

Cops7a, COP9 signalosome complex subunit 7a, mousemouse

Predictions only

Length 275 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cops7aQ9CZ04 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cops7aQ9CZ04 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cops7aQ9CZ04 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cops7aQ9CZ04 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cops7aQ9CZ04 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cops7aQ9CZ04 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cops7aQ9CZ04 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cops7aQ9CZ04 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cops7aQ9CZ04 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Cops7aQ9CZ04 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cops7aQ9CZ04 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cops7aQ9CZ04 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cops7aQ9CZ04 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cops7aQ9CZ04 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cops7aQ9CZ04 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cops7aQ9CZ04 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cops7aQ9CZ04 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cops7aQ9CZ04 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cops7aQ9CZ04 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cops7aQ9CZ04 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Cops7aQ9CZ04 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cops7aQ9CZ04 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cops7aQ9CZ04 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cops7aQ9CZ04 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cops7aQ9CZ04 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cops7aQ9CZ04 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cops7aQ9CZ04 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cops7aQ9CZ04 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cops7aQ9CZ04 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cops7aQ9CZ04 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cops7aQ9CZ04 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cops7aQ9CZ04 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cops7aQ9CZ04 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cops7aQ9CZ04 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cops7aQ9CZ04 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Cops7aQ9CZ04 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cops7aQ9CZ04 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cops7aQ9CZ04 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cops7aQ9CZ04 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cops7aQ9CZ04 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cops7aQ9CZ04 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cops7aQ9CZ04 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cops7aQ9CZ04 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cops7aQ9CZ04 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cops7aQ9CZ04 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cops7aQ9CZ04 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cops7aQ9CZ04 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cops7aQ9CZ04 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cops7aQ9CZ04 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cops7aQ9CZ04 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cops7aQ9CZ04 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cops7aQ9CZ04 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cops7aQ9CZ04 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cops7aQ9CZ04 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cops7aQ9CZ04 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cops7aQ9CZ04 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cops7aQ9CZ04 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cops7aQ9CZ04 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cops7aQ9CZ04 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cops7aQ9CZ04 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cops7aQ9CZ04 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cops7aQ9CZ04 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cops7aQ9CZ04 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cops7aQ9CZ04 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Cops7aQ9CZ04 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cops7aQ9CZ04 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cops7aQ9CZ04 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cops7aQ9CZ04 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cops7aQ9CZ04 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cops7aQ9CZ04 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cops7aQ9CZ04 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cops7aQ9CZ04 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cops7aQ9CZ04 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cops7aQ9CZ04 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cops7aQ9CZ04 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cops7aQ9CZ04 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cops7aQ9CZ04 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cops7aQ9CZ04 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cops7aQ9CZ04 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cops7aQ9CZ04 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cops7aQ9CZ04 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cops7aQ9CZ04 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cops7aQ9CZ04 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cops7aQ9CZ04 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cops7aQ9CZ04 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cops7aQ9CZ04 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cops7aQ9CZ04 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cops7aQ9CZ04 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cops7aQ9CZ04 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cops7aQ9CZ04 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cops7aQ9CZ04 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cops7aQ9CZ04 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Cops7aQ9CZ04 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cops7aQ9CZ04 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cops7aQ9CZ04 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cops7aQ9CZ04 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cops7aQ9CZ04 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cops7aQ9CZ04 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cops7aQ9CZ04 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cops7aQ9CZ04 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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