Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY97

Ssu72, RNA polymerase II subunit A C-terminal domain phosphatase SSU72, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssu72Q9CY97 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ssu72Q9CY97 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ssu72Q9CY97 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ssu72Q9CY97 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ssu72Q9CY97 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ssu72Q9CY97 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ssu72Q9CY97 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ssu72Q9CY97 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Ssu72Q9CY97 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ssu72Q9CY97 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Ssu72Q9CY97 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ssu72Q9CY97 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ssu72Q9CY97 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ssu72Q9CY97 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ssu72Q9CY97 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ssu72Q9CY97 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Ssu72Q9CY97 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ssu72Q9CY97 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Ssu72Q9CY97 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ssu72Q9CY97 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ssu72Q9CY97 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ssu72Q9CY97 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ssu72Q9CY97 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ssu72Q9CY97 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ssu72Q9CY97 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ssu72Q9CY97 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ssu72Q9CY97 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ssu72Q9CY97 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ssu72Q9CY97 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ssu72Q9CY97 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ssu72Q9CY97 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ssu72Q9CY97 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ssu72Q9CY97 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ssu72Q9CY97 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ssu72Q9CY97 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ssu72Q9CY97 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ssu72Q9CY97 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ssu72Q9CY97 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ssu72Q9CY97 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ssu72Q9CY97 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ssu72Q9CY97 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ssu72Q9CY97 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ssu72Q9CY97 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ssu72Q9CY97 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ssu72Q9CY97 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ssu72Q9CY97 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ssu72Q9CY97 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ssu72Q9CY97 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ssu72Q9CY97 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ssu72Q9CY97 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ssu72Q9CY97 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ssu72Q9CY97 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ssu72Q9CY97 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ssu72Q9CY97 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ssu72Q9CY97 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ssu72Q9CY97 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ssu72Q9CY97 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ssu72Q9CY97 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ssu72Q9CY97 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ssu72Q9CY97 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ssu72Q9CY97 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ssu72Q9CY97 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ssu72Q9CY97 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ssu72Q9CY97 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ssu72Q9CY97 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ssu72Q9CY97 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ssu72Q9CY97 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ssu72Q9CY97 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ssu72Q9CY97 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ssu72Q9CY97 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ssu72Q9CY97 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ssu72Q9CY97 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ssu72Q9CY97 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ssu72Q9CY97 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ssu72Q9CY97 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ssu72Q9CY97 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ssu72Q9CY97 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ssu72Q9CY97 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ssu72Q9CY97 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ssu72Q9CY97 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ssu72Q9CY97 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ssu72Q9CY97 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ssu72Q9CY97 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ssu72Q9CY97 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ssu72Q9CY97 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ssu72Q9CY97 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ssu72Q9CY97 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ssu72Q9CY97 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ssu72Q9CY97 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ssu72Q9CY97 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ssu72Q9CY97 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ssu72Q9CY97 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ssu72Q9CY97 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ssu72Q9CY97 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ssu72Q9CY97 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ssu72Q9CY97 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ssu72Q9CY97 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ssu72Q9CY97 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ssu72Q9CY97 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ssu72Q9CY97 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms