Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY18

Snx7, Sorting nexin-7, mousemouse

Predictions only

Length 387 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx7Q9CY18 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snx7Q9CY18 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snx7Q9CY18 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snx7Q9CY18 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snx7Q9CY18 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snx7Q9CY18 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snx7Q9CY18 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snx7Q9CY18 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snx7Q9CY18 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snx7Q9CY18 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snx7Q9CY18 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snx7Q9CY18 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snx7Q9CY18 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snx7Q9CY18 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snx7Q9CY18 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snx7Q9CY18 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snx7Q9CY18 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snx7Q9CY18 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Snx7Q9CY18 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snx7Q9CY18 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snx7Q9CY18 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snx7Q9CY18 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snx7Q9CY18 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snx7Q9CY18 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snx7Q9CY18 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snx7Q9CY18 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snx7Q9CY18 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snx7Q9CY18 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snx7Q9CY18 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snx7Q9CY18 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snx7Q9CY18 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snx7Q9CY18 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snx7Q9CY18 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snx7Q9CY18 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snx7Q9CY18 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snx7Q9CY18 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snx7Q9CY18 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snx7Q9CY18 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snx7Q9CY18 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snx7Q9CY18 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snx7Q9CY18 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snx7Q9CY18 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snx7Q9CY18 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snx7Q9CY18 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snx7Q9CY18 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snx7Q9CY18 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snx7Q9CY18 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snx7Q9CY18 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Snx7Q9CY18 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Snx7Q9CY18 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snx7Q9CY18 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snx7Q9CY18 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snx7Q9CY18 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snx7Q9CY18 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snx7Q9CY18 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snx7Q9CY18 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Snx7Q9CY18 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Snx7Q9CY18 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Snx7Q9CY18 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Snx7Q9CY18 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Snx7Q9CY18 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Snx7Q9CY18 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Snx7Q9CY18 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Snx7Q9CY18 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Snx7Q9CY18 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Snx7Q9CY18 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Snx7Q9CY18 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Snx7Q9CY18 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Snx7Q9CY18 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Snx7Q9CY18 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Snx7Q9CY18 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Snx7Q9CY18 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Snx7Q9CY18 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Snx7Q9CY18 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Snx7Q9CY18 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Snx7Q9CY18 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Snx7Q9CY18 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Snx7Q9CY18 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Snx7Q9CY18 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Snx7Q9CY18 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Snx7Q9CY18 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Snx7Q9CY18 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Snx7Q9CY18 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Snx7Q9CY18 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Snx7Q9CY18 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Snx7Q9CY18 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Snx7Q9CY18 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Snx7Q9CY18 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Snx7Q9CY18 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Snx7Q9CY18 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Snx7Q9CY18 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Snx7Q9CY18 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Snx7Q9CY18 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Snx7Q9CY18 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Snx7Q9CY18 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Snx7Q9CY18 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Snx7Q9CY18 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Snx7Q9CY18 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Snx7Q9CY18 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Snx7Q9CY18 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.9 ms